More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0885 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0885  cysteine synthase  100 
 
 
303 aa  616  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1287  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  71.95 
 
 
304 aa  416  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.870324  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1759  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  67.11 
 
 
303 aa  389  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.33 
 
 
307 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  59.67 
 
 
307 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  59 
 
 
307 aa  361  8e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  59.33 
 
 
307 aa  360  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  59.33 
 
 
307 aa  360  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  59.33 
 
 
307 aa  360  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  59.33 
 
 
307 aa  360  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  59.33 
 
 
307 aa  360  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1553  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  63.82 
 
 
304 aa  360  1e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  59.33 
 
 
307 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  57.62 
 
 
307 aa  359  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  59.33 
 
 
307 aa  359  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  58.67 
 
 
307 aa  358  6e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  58.67 
 
 
307 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0094  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  51.85 
 
 
302 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.84 
 
 
302 aa  290  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.52 
 
 
302 aa  287  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  50 
 
 
302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0494  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.35 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0481  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  51.35 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000231361  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.32 
 
 
315 aa  279  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  50.33 
 
 
302 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  43.65 
 
 
311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  41.97 
 
 
304 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  42.81 
 
 
312 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  43.05 
 
 
304 aa  249  4e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  43.79 
 
 
308 aa  249  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.13 
 
 
326 aa  247  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629074  normal  0.0111881 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  43.81 
 
 
302 aa  247  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  42.72 
 
 
307 aa  247  2e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  44.04 
 
 
308 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1013  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.09 
 
 
326 aa  246  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  46.23 
 
 
308 aa  245  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  42.09 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  42.48 
 
 
329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  44.88 
 
 
305 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  45.31 
 
 
310 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  40.8 
 
 
304 aa  242  6e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  40.33 
 
 
311 aa  242  6e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  44.26 
 
 
317 aa  242  6e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  46.25 
 
 
327 aa  241  9e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  42.33 
 
 
306 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  44.26 
 
 
310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  42.3 
 
 
305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  43.93 
 
 
306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  44.55 
 
 
309 aa  239  5e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3195  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.05 
 
 
326 aa  238  5.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421019  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0932  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.69 
 
 
327 aa  238  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  40.46 
 
 
304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  42.24 
 
 
307 aa  235  6e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  41.89 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  42.24 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  40.79 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  44.03 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  42.43 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  41.58 
 
 
461 aa  232  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  43.28 
 
 
311 aa  232  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  45.21 
 
 
309 aa  232  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  44.08 
 
 
317 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  39.54 
 
 
315 aa  231  8.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  41.91 
 
 
307 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  44.04 
 
 
310 aa  231  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  40.26 
 
 
323 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  40 
 
 
303 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  43.62 
 
 
320 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  44.59 
 
 
331 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  43.09 
 
 
309 aa  229  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  41.5 
 
 
309 aa  230  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  43.61 
 
 
309 aa  229  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  42.95 
 
 
329 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  41.69 
 
 
310 aa  229  4e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  40.73 
 
 
298 aa  229  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  43.96 
 
 
320 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  42.24 
 
 
308 aa  229  5e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  41.58 
 
 
321 aa  229  6e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  42.67 
 
 
305 aa  228  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  42.43 
 
 
305 aa  228  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  38.61 
 
 
310 aa  226  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  38.94 
 
 
310 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  38.94 
 
 
310 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  42.11 
 
 
305 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  43.43 
 
 
320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  40.72 
 
 
299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  41.14 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  43.05 
 
 
308 aa  225  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  42.48 
 
 
320 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  42.57 
 
 
310 aa  225  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  40.92 
 
 
307 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  43.28 
 
 
311 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  44.3 
 
 
316 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  41.78 
 
 
305 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  44.66 
 
 
309 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  43.71 
 
 
309 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  41.91 
 
 
309 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  42 
 
 
306 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  42.43 
 
 
309 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  41.78 
 
 
305 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>