More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1228 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 302 aa  610  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  71.85 
 
 		 302 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  63.88 
 
 		 302 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  64.55 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  51.16 
 
 		 307 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.83 
 
 		 307 aa  305  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.34 
 
 		 307 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  51.16 
 
 		 307 aa  305  7e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  50.83 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  50.83 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  50.83 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  50.83 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  50.83 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  50.5 
 
 		 307 aa  301  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.83 
 
 		 307 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.33 
 
 		 307 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  50.5 
 
 		 307 aa  301  9e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  46.49 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  47.33 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0885  cysteine synthase  48.84 
 
 		 303 aa  269  5e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  47.02 
 
 		 311 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  44.22 
 
 		 312 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  44.22 
 
 		 312 aa  258  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.97 
 
 		 459 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  44.63 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1759  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  49.17 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1287  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.19 
 
 		 304 aa  251  7e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.870324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  43.75 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  44.23 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  43.37 
 
 		 332 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  44.52 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  44.52 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  42.35 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  45.15 
 
 		 320 aa  246  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.02 
 
 		 459 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.69 
 
 		 459 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  45.15 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  44.22 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  44.48 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  41.67 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  43.09 
 
 		 304 aa  242  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  42.02 
 
 		 310 aa  241  7.999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  45.21 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  42 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  42.9 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  42.9 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  42.86 
 
 		 310 aa  238  8e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  41.91 
 
 		 304 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  43.14 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  41.39 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  43.81 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  42.9 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  44.88 
 
 		 316 aa  237  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  41.78 
 
 		 773 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  43.79 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  45.67 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  39.02 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  42.57 
 
 		 309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  44.26 
 
 		 304 aa  235  7e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  44.84 
 
 		 463 aa  234  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  42.05 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  43.56 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  43.05 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  44.55 
 
 		 456 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  41.64 
 
 		 339 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  41.91 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.48 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0481  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.2 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000231361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  43.69 
 
 		 316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  43 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0494  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.2 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  43.23 
 
 		 309 aa  232  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  44.55 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  43.56 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  41.86 
 
 		 317 aa  232  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  45.03 
 
 		 305 aa  232  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  43.48 
 
 		 306 aa  232  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  39.94 
 
 		 387 aa  232  7.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  42.62 
 
 		 327 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  44.92 
 
 		 309 aa  231  8.000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  43.89 
 
 		 302 aa  231  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  44.7 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  43.33 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  41.25 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  42.76 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  43.42 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  41.04 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  44.22 
 
 		 456 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  42.26 
 
 		 458 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.35 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  43.23 
 
 		 314 aa  229  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  43.42 
 
 		 309 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  43.38 
 
 		 340 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  41.06 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  40.67 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  45.07 
 
 		 454 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.38 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  42.05 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  42.52 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  40.59 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>