More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0494 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0494  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
318 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0481  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 
318 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000231361  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0094  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  71.48 
 
 
302 aa  442  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  52.03 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  52.03 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  52.03 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  52.03 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  52.03 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.18 
 
 
307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  52.36 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  52.03 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.85 
 
 
307 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  52.03 
 
 
307 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.34 
 
 
307 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  51.69 
 
 
307 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.68 
 
 
307 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0885  cysteine synthase  51.35 
 
 
303 aa  263  4e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1759  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  51.18 
 
 
303 aa  256  3e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  47.62 
 
 
302 aa  255  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1287  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  48.31 
 
 
304 aa  251  9.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.870324  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1553  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  49.83 
 
 
304 aa  247  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222613  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  45.39 
 
 
302 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.2 
 
 
302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  47.62 
 
 
302 aa  232  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  42.47 
 
 
315 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  40.27 
 
 
310 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  41.31 
 
 
461 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  39.4 
 
 
310 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  39.4 
 
 
310 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  39.33 
 
 
455 aa  202  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0932  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.3 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  39.32 
 
 
312 aa  199  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  38.98 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  38.83 
 
 
321 aa  194  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  38.39 
 
 
302 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  38.46 
 
 
298 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  40.07 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  37.16 
 
 
304 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  40 
 
 
456 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  37.07 
 
 
306 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  39.67 
 
 
456 aa  188  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.69 
 
 
465 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  36.08 
 
 
301 aa  186  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  40 
 
 
463 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  38.33 
 
 
456 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  37.5 
 
 
304 aa  186  6e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  37.75 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  36.67 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  37.21 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  38.8 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.06 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629074  normal  0.0111881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  40.27 
 
 
454 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  40 
 
 
456 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1013  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.72 
 
 
326 aa  182  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  39.86 
 
 
290 aa  182  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  36.57 
 
 
329 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  39 
 
 
455 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3195  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.35 
 
 
326 aa  182  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  39.32 
 
 
307 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  39.6 
 
 
307 aa  181  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  39.46 
 
 
320 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  39.41 
 
 
338 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  39.8 
 
 
291 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  38.36 
 
 
458 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  39.59 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  39.02 
 
 
324 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  38.98 
 
 
307 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1337  cysteine synthase A  41.36 
 
 
310 aa  180  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241539  normal  0.869018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  38.11 
 
 
461 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  35.76 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  40.4 
 
 
317 aa  179  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  38.13 
 
 
311 aa  179  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  37.33 
 
 
297 aa  179  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  38.46 
 
 
305 aa  178  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  40.33 
 
 
457 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  40.26 
 
 
317 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  39.13 
 
 
310 aa  178  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  39.26 
 
 
307 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  39.13 
 
 
460 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  39.6 
 
 
454 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  37.37 
 
 
304 aa  177  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  40 
 
 
310 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  38.44 
 
 
462 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  38.56 
 
 
463 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  38.7 
 
 
320 aa  176  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  39.32 
 
 
309 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  35.97 
 
 
291 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  34.89 
 
 
387 aa  176  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  40.4 
 
 
307 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  37.63 
 
 
307 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  38.82 
 
 
331 aa  176  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  39.19 
 
 
309 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  36.91 
 
 
297 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.33 
 
 
459 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  34.29 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  39.13 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  37.95 
 
 
464 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  39 
 
 
464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  40.33 
 
 
465 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  39.13 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>