More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1358 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  100 
 
 		 316 aa  643    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  80.25 
 
 		 315 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  78.66 
 
 		 315 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  76.43 
 
 		 315 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  77.39 
 
 		 315 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  76.75 
 
 		 315 aa  498  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5652  cysteine synthase  80.25 
 
 		 315 aa  495  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.397691  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1698  cysteine synthase  76.66 
 
 		 317 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137932  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29160  cysteine synthase  75 
 
 		 316 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1728  cysteine synthase B  76.43 
 
 		 315 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1312  cysteine synthase  75.86 
 
 		 320 aa  491  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0868  cysteine synthase  78.66 
 
 		 315 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  74.52 
 
 		 315 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  71.17 
 
 		 326 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4291  cysteine synthases  74.69 
 
 		 320 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1011  cysteine synthase  75.32 
 
 		 316 aa  461  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3834  cysteine synthase  73.37 
 
 		 323 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.124032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1102  cysteine synthase  73.21 
 
 		 321 aa  457  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3848  cysteine synthase  73.37 
 
 		 323 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3922  cysteine synthase  73.37 
 
 		 323 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1291  cysteine synthase  74.09 
 
 		 328 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2354  cysteine synthase  72.53 
 
 		 324 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0991  cysteine synthase  72.9 
 
 		 337 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145876  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1541  cysteine synthase  66.77 
 
 		 316 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1846  cysteine synthase  54.14 
 
 		 323 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  47.14 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  46.69 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  47.68 
 
 		 300 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  47.68 
 
 		 300 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  48.34 
 
 		 311 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  47.68 
 
 		 300 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  47.68 
 
 		 300 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  47.68 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  47.02 
 
 		 300 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  46.46 
 
 		 296 aa  261  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  46.46 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  45.18 
 
 		 300 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  45.51 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  46.69 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  45.36 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  45.18 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  46.36 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  45.45 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  45.03 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  45.36 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  45.36 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  45.36 
 
 		 303 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  45.36 
 
 		 303 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  45.36 
 
 		 303 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  45.36 
 
 		 303 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  44.41 
 
 		 307 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  46.67 
 
 		 297 aa  255  8e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  45.03 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  45.73 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  43.42 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  46.18 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2993  cysteine synthase B  46.36 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  hitchhiker  0.00110964 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  46.49 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0990  cysteine synthase B  46.03 
 
 		 300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  43.85 
 
 		 306 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  43.42 
 
 		 301 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  45.48 
 
 		 297 aa  252  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  44.52 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  45.42 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  45.42 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  47.46 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  45.03 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  45.72 
 
 		 301 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2221  cysteine synthase B  47.47 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  47.28 
 
 		 299 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  44.59 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  43.81 
 
 		 298 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  47.28 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  42.05 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  42.9 
 
 		 773 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  43.96 
 
 		 313 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  43.77 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  43.73 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  43.39 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  43.96 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  43.73 
 
 		 303 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  43.62 
 
 		 312 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  43.73 
 
 		 303 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  43.39 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  42.67 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  42.11 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  43.29 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  43.29 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  42.76 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  42.76 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  42.76 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  41.95 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  42.76 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  42.76 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  42.38 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  42.76 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  42.76 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  42.72 
 
 		 300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  42.76 
 
 		 303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  42.42 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>