More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0991 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0991  cysteine synthase  100 
 
 
337 aa  675    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145876  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1102  cysteine synthase  94.7 
 
 
321 aa  585  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  75.55 
 
 
315 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  74.92 
 
 
315 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  72.9 
 
 
316 aa  477  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  73.35 
 
 
315 aa  477  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  71.47 
 
 
315 aa  471  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  72.1 
 
 
315 aa  471  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1698  cysteine synthase  73.6 
 
 
317 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137932  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  71.16 
 
 
315 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1728  cysteine synthase B  71.47 
 
 
315 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1312  cysteine synthase  71.47 
 
 
320 aa  464  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29160  cysteine synthase  70.09 
 
 
316 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  69.63 
 
 
326 aa  458  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5652  cysteine synthase  75.24 
 
 
315 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.397691  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1291  cysteine synthase  75.3 
 
 
328 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0868  cysteine synthase  71.79 
 
 
315 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4291  cysteine synthases  71.65 
 
 
320 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1011  cysteine synthase  74.14 
 
 
316 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3834  cysteine synthase  71.21 
 
 
323 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.124032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3848  cysteine synthase  71.21 
 
 
323 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3922  cysteine synthase  71.21 
 
 
323 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2354  cysteine synthase  70.68 
 
 
324 aa  434  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897277  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1541  cysteine synthase  66.04 
 
 
316 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1846  cysteine synthase  49.39 
 
 
323 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  45.9 
 
 
300 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  45.9 
 
 
300 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  45.07 
 
 
297 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  45.9 
 
 
325 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  45.57 
 
 
300 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  45.57 
 
 
300 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  44.92 
 
 
303 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  44.77 
 
 
307 aa  245  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  44.59 
 
 
300 aa  245  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  43.71 
 
 
295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  44.48 
 
 
311 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  44.92 
 
 
300 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  44.26 
 
 
303 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  43.71 
 
 
300 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  44.26 
 
 
303 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  44.26 
 
 
303 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  44.26 
 
 
303 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  44.26 
 
 
303 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  44.26 
 
 
300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  44.26 
 
 
300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  44.7 
 
 
300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  44.04 
 
 
300 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  43.97 
 
 
302 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  43.61 
 
 
301 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  43.71 
 
 
306 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  42.9 
 
 
300 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  43.38 
 
 
301 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  43.71 
 
 
300 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  43.71 
 
 
300 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  42.05 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  44.92 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  43.38 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  44.37 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2993  cysteine synthase B  42.62 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  hitchhiker  0.00110964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0990  cysteine synthase B  42.62 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  42.05 
 
 
300 aa  232  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  43.05 
 
 
300 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  43.46 
 
 
299 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  42.72 
 
 
299 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  43.46 
 
 
354 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  43.38 
 
 
296 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  40.59 
 
 
300 aa  229  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  41.81 
 
 
294 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  41.81 
 
 
294 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  39.81 
 
 
312 aa  226  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  42.3 
 
 
297 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  39.48 
 
 
312 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  41.78 
 
 
297 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  42.24 
 
 
300 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  41.04 
 
 
773 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  41.42 
 
 
313 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  40.33 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  41.91 
 
 
299 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  40.4 
 
 
299 aa  219  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  39.8 
 
 
290 aa  218  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  41.58 
 
 
300 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  37.99 
 
 
304 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  45.28 
 
 
305 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  40.59 
 
 
299 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  40.59 
 
 
312 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  38.03 
 
 
291 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  42.57 
 
 
298 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  40.26 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  42.3 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  41.97 
 
 
303 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  41.25 
 
 
768 aa  216  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  40.92 
 
 
312 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  41.86 
 
 
303 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  42.31 
 
 
315 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  40.73 
 
 
299 aa  215  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0508  cysteine synthase B  42.72 
 
 
303 aa  215  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  41.97 
 
 
303 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  42.19 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  42.38 
 
 
293 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  41.72 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>