More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1541 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1541  cysteine synthase  100 
 
 		 316 aa  639    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  72.61 
 
 		 315 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  71.02 
 
 		 315 aa  475  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  71.02 
 
 		 315 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  72.29 
 
 		 315 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  70.7 
 
 		 315 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  70.38 
 
 		 315 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  68.4 
 
 		 326 aa  458  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1728  cysteine synthase B  69.75 
 
 		 315 aa  457  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29160  cysteine synthase  68.67 
 
 		 316 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  66.77 
 
 		 316 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1698  cysteine synthase  67.82 
 
 		 317 aa  448  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137932  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1312  cysteine synthase  66.77 
 
 		 320 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1011  cysteine synthase  70.25 
 
 		 316 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5652  cysteine synthase  69.75 
 
 		 315 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.397691  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0868  cysteine synthase  68.15 
 
 		 315 aa  428  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1102  cysteine synthase  67.6 
 
 		 321 aa  424  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1291  cysteine synthase  68.6 
 
 		 328 aa  421  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4291  cysteine synthases  67.19 
 
 		 320 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2354  cysteine synthase  65.74 
 
 		 324 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3834  cysteine synthase  66.87 
 
 		 323 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.124032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3848  cysteine synthase  66.56 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3922  cysteine synthase  66.56 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0991  cysteine synthase  66.04 
 
 		 337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145876  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1846  cysteine synthase  50.96 
 
 		 323 aa  282  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  48.45 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  48.63 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  46.03 
 
 		 300 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  46.03 
 
 		 300 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  46.03 
 
 		 325 aa  254  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  46.36 
 
 		 303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  45.7 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  45.7 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  46.03 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  46.03 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  46.03 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  46.03 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  46.03 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  46.03 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  44.7 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  44.7 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  45.03 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  44.44 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  44.44 
 
 		 295 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  48.31 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  45.39 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  45.39 
 
 		 354 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  43.19 
 
 		 311 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  42.52 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  44.11 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  43.19 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2993  cysteine synthase B  43.38 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  hitchhiker  0.00110964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0990  cysteine synthase B  43.71 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  43.19 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  44.19 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  42.19 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  43.62 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  42.38 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  43.52 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  44.14 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  44.14 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  42.95 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  43.09 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  42.95 
 
 		 300 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  41.97 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  41.81 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  40.2 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  48.12 
 
 		 308 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  41.2 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  43.09 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  41.53 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  45.3 
 
 		 305 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  42.09 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  40.13 
 
 		 304 aa  225  8e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  40.73 
 
 		 300 aa  225  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  43.61 
 
 		 764 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  42.62 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  42.33 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  40.13 
 
 		 773 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  39.26 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1285  cysteine synthase  43.29 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  42.39 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  40.46 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0508  cysteine synthase B  41.72 
 
 		 303 aa  221  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  39.47 
 
 		 312 aa  221  9e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  40.46 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  38.67 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  40.6 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  41.41 
 
 		 299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  38.82 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  40.13 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  40.34 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  40.67 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  41.72 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  43.73 
 
 		 305 aa  219  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  41.39 
 
 		 303 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  50.17 
 
 		 308 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  41.39 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  39.07 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  41.72 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>