More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0830 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  100 
 
 		 764 aa  1562    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  51.69 
 
 		 768 aa  735    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  42.27 
 
 		 773 aa  570  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  43.82 
 
 		 771 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  57.19 
 
 		 302 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  56.45 
 
 		 299 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  51.17 
 
 		 318 aa  317  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  56.1 
 
 		 354 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  54.11 
 
 		 305 aa  301  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  53.26 
 
 		 308 aa  299  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  54.64 
 
 		 305 aa  293  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  52.74 
 
 		 307 aa  291  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  52.17 
 
 		 308 aa  283  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  50.87 
 
 		 305 aa  280  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  50.17 
 
 		 297 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0231  cysteine synthase B  51.36 
 
 		 321 aa  271  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  50.87 
 
 		 296 aa  270  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  49.31 
 
 		 303 aa  269  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  51.19 
 
 		 322 aa  268  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  50.69 
 
 		 293 aa  267  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  50.68 
 
 		 303 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  50.69 
 
 		 294 aa  267  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  48.98 
 
 		 295 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  47.78 
 
 		 299 aa  266  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  46.76 
 
 		 290 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  54.51 
 
 		 308 aa  265  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  49.48 
 
 		 293 aa  264  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  50.52 
 
 		 292 aa  264  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  50.52 
 
 		 292 aa  264  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  47.74 
 
 		 294 aa  264  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  50 
 
 		 299 aa  263  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  47.74 
 
 		 294 aa  264  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  50.34 
 
 		 300 aa  263  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  48.47 
 
 		 300 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  46.1 
 
 		 299 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  50.34 
 
 		 303 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  50.34 
 
 		 303 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  50.34 
 
 		 303 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0839  cysteine synthase B  48.5 
 
 		 316 aa  263  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0067092  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  46.1 
 
 		 312 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  50.34 
 
 		 303 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  50.17 
 
 		 297 aa  263  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  47.62 
 
 		 297 aa  263  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  49.15 
 
 		 297 aa  263  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  45.67 
 
 		 312 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  50.34 
 
 		 300 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  49.66 
 
 		 300 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  50.34 
 
 		 300 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  50 
 
 		 300 aa  262  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  50.17 
 
 		 292 aa  262  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  49.66 
 
 		 300 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  45.67 
 
 		 299 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  46.44 
 
 		 312 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  48.96 
 
 		 295 aa  261  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  49.66 
 
 		 325 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  49.66 
 
 		 300 aa  261  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  50.34 
 
 		 303 aa  261  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  49.13 
 
 		 293 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  49.66 
 
 		 300 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  48.61 
 
 		 303 aa  260  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  48.61 
 
 		 303 aa  260  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  47.3 
 
 		 313 aa  260  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  47.92 
 
 		 303 aa  260  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  47.92 
 
 		 303 aa  260  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  47.92 
 
 		 303 aa  260  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  47.92 
 
 		 303 aa  260  8e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  47.92 
 
 		 303 aa  260  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  47.92 
 
 		 303 aa  260  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  48.96 
 
 		 303 aa  260  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  48.61 
 
 		 303 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  48.96 
 
 		 303 aa  260  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  47.92 
 
 		 303 aa  259  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  48.43 
 
 		 297 aa  259  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  47.92 
 
 		 303 aa  259  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  44.52 
 
 		 294 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  46.05 
 
 		 294 aa  259  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  47.62 
 
 		 313 aa  259  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  45.33 
 
 		 299 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  47.57 
 
 		 303 aa  258  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  46.08 
 
 		 295 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  49.66 
 
 		 302 aa  254  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  47.42 
 
 		 300 aa  255  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  45.51 
 
 		 306 aa  254  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  45.24 
 
 		 290 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  47.14 
 
 		 300 aa  254  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  48.45 
 
 		 300 aa  254  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  45.61 
 
 		 299 aa  253  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  46.8 
 
 		 300 aa  253  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  47.64 
 
 		 298 aa  253  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  48.3 
 
 		 311 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  46.46 
 
 		 300 aa  251  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  47.87 
 
 		 308 aa  251  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2993  cysteine synthase B  48.97 
 
 		 300 aa  250  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  hitchhiker  0.00110964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0990  cysteine synthase B  48.97 
 
 		 300 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  48.46 
 
 		 303 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  47.42 
 
 		 300 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  45.45 
 
 		 300 aa  249  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  44.93 
 
 		 301 aa  249  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  46.05 
 
 		 300 aa  248  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  45.12 
 
 		 300 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>