More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0264 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  100 
 
 		 308 aa  623  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  89.29 
 
 		 308 aa  522  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  76.3 
 
 		 307 aa  461  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  70.92 
 
 		 308 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  68.79 
 
 		 299 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  68.79 
 
 		 354 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  68.69 
 
 		 302 aa  418  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  69.54 
 
 		 305 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  67.11 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  51.7 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  53.92 
 
 		 773 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  53.18 
 
 		 771 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  49.66 
 
 		 294 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  49.66 
 
 		 294 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  50 
 
 		 305 aa  288  6e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  51.74 
 
 		 299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  51.56 
 
 		 297 aa  285  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  52.17 
 
 		 764 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  48.81 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  49.15 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  49.15 
 
 		 303 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  49.49 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  49.15 
 
 		 303 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  48.46 
 
 		 303 aa  278  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  49.15 
 
 		 303 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  48.46 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  48.46 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  48.46 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  48.46 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  48.46 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  48.05 
 
 		 768 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  48.12 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  49.49 
 
 		 297 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  47.78 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  47.44 
 
 		 303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  49.32 
 
 		 302 aa  271  8.000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  50.17 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  46.42 
 
 		 293 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  46.42 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  48.61 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  46.76 
 
 		 293 aa  265  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  46.64 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  47.65 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  46.31 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  47.99 
 
 		 303 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  49.15 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  47.65 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  47.83 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  47.65 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  46 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  46.31 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  47.65 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  47.65 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  47.65 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  47.65 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  46.1 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  45.39 
 
 		 312 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  48.81 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  46.08 
 
 		 298 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  45.73 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  44.71 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  47.32 
 
 		 295 aa  262  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  44.71 
 
 		 312 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  45.64 
 
 		 300 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  45.64 
 
 		 300 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  46.31 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  45.64 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  46.76 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  46.13 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  44.97 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  46.28 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  44.03 
 
 		 312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  45.73 
 
 		 295 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  44.97 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  46.82 
 
 		 311 aa  258  8e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  45.05 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  46.13 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  45.05 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  46.76 
 
 		 296 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2221  cysteine synthase B  47.92 
 
 		 295 aa  256  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  45.05 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  45.79 
 
 		 300 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  44.78 
 
 		 299 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  45.73 
 
 		 313 aa  255  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  45.08 
 
 		 297 aa  254  9e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  45.12 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  47.1 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  46.18 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  45.12 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  47.78 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  44.03 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3609  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.01 
 
 		 317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.746552  normal  0.0138185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  47.44 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  47.44 
 
 		 315 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  43.54 
 
 		 301 aa  252  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  44.48 
 
 		 290 aa  252  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  43.69 
 
 		 299 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  45.97 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  46.28 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1728  cysteine synthase B  48.12 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>