More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3158 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  100 
 
 		 308 aa  623  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  89.29 
 
 		 308 aa  541  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  76.62 
 
 		 307 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  73.86 
 
 		 308 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  69.46 
 
 		 299 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  69.46 
 
 		 354 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  68.69 
 
 		 302 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  67.88 
 
 		 305 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  67.44 
 
 		 305 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  51.36 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  53.92 
 
 		 773 aa  311  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  53.51 
 
 		 771 aa  295  7e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  50.84 
 
 		 299 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  50.34 
 
 		 294 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  50.34 
 
 		 294 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  52.25 
 
 		 297 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  50.34 
 
 		 305 aa  285  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  53.18 
 
 		 764 aa  280  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  50.17 
 
 		 297 aa  279  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  48.81 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  47.78 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  49.15 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  49.15 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  48.81 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  48.81 
 
 		 303 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  48.59 
 
 		 768 aa  275  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  47.78 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  47.78 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  47.78 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  47.78 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  47.78 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  47.78 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  47.46 
 
 		 313 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  48.12 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  47.44 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  49.32 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  48.61 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  47.1 
 
 		 303 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  50.35 
 
 		 303 aa  268  8e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  50.17 
 
 		 315 aa  267  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  48.99 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  48.26 
 
 		 297 aa  266  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  46.76 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  47.65 
 
 		 295 aa  266  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  46.08 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  48.66 
 
 		 303 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  48.66 
 
 		 303 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  48.66 
 
 		 303 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  48.66 
 
 		 303 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  48.66 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  48.66 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  47.99 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  49.49 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  46.42 
 
 		 293 aa  262  4.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  46.98 
 
 		 300 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  46.98 
 
 		 300 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  46.98 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  46.15 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  46.31 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  46.64 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  46.31 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  44.82 
 
 		 312 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  46.31 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  44.15 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  47.16 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  44.71 
 
 		 312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2221  cysteine synthase B  48.96 
 
 		 295 aa  258  7e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  45.21 
 
 		 300 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  43.81 
 
 		 312 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  45.39 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  45.21 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  44.22 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  44.71 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  45.17 
 
 		 290 aa  255  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  45.95 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  48.12 
 
 		 315 aa  255  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  47.16 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  44.37 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  44.44 
 
 		 307 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  45.39 
 
 		 295 aa  255  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  44.71 
 
 		 292 aa  255  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  45.45 
 
 		 301 aa  255  8e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  44.71 
 
 		 292 aa  255  8e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  46.64 
 
 		 301 aa  255  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  45.87 
 
 		 300 aa  254  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  44.71 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  45.05 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  45.45 
 
 		 299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  46.44 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  45.45 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1728  cysteine synthase B  48.81 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  44.11 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  47.44 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  47.22 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  47.78 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  46.13 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  44.11 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  44.48 
 
 		 313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  47.78 
 
 		 316 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  45.39 
 
 		 294 aa  252  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>