More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2678 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  100 
 
 
318 aa  650    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  53.2 
 
 
773 aa  335  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  53.24 
 
 
308 aa  334  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  54.76 
 
 
302 aa  332  6e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  53.85 
 
 
307 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  53.08 
 
 
771 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  50.68 
 
 
299 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  50.68 
 
 
354 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  51.17 
 
 
764 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  51.7 
 
 
308 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  53.06 
 
 
305 aa  301  9e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  52.68 
 
 
305 aa  298  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  50.16 
 
 
768 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0231  cysteine synthase B  50.85 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  51.36 
 
 
322 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  46.6 
 
 
305 aa  279  5e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  47.46 
 
 
317 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  51.36 
 
 
308 aa  276  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0839  cysteine synthase B  50.67 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0067092  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  45.24 
 
 
290 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  45.89 
 
 
290 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0720  cysteine synthase  45.42 
 
 
321 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814603  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  46.41 
 
 
312 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0315  cysteine synthase  44.93 
 
 
318 aa  255  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.70232  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3609  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.54 
 
 
317 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.746552  normal  0.0138185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  46.41 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0952  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.42 
 
 
309 aa  252  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  45.28 
 
 
311 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  43.54 
 
 
297 aa  248  7e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  45.9 
 
 
308 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  44.48 
 
 
296 aa  246  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  43.64 
 
 
296 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  44.11 
 
 
297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  41.87 
 
 
294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  41.87 
 
 
294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  41.55 
 
 
303 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  41.89 
 
 
303 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  42.18 
 
 
303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  43.6 
 
 
299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  41.55 
 
 
303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  41.22 
 
 
303 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  41.22 
 
 
303 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  45.28 
 
 
308 aa  241  9e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  43.84 
 
 
294 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  43.55 
 
 
295 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  41.5 
 
 
303 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  41.87 
 
 
294 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  42.21 
 
 
295 aa  240  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  43.34 
 
 
294 aa  240  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  41.5 
 
 
303 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  41.5 
 
 
303 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  42.67 
 
 
311 aa  239  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  44.26 
 
 
300 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  42.52 
 
 
302 aa  239  4e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  41.5 
 
 
303 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  41.5 
 
 
303 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  41.52 
 
 
293 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  41.5 
 
 
303 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  43.55 
 
 
292 aa  239  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  43.55 
 
 
292 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  42.71 
 
 
313 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  42.95 
 
 
300 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.740754 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  41.16 
 
 
303 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  41.16 
 
 
303 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  43.28 
 
 
300 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  43.28 
 
 
300 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  41.1 
 
 
299 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  41.12 
 
 
300 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  42.3 
 
 
300 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  42.3 
 
 
300 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  42.3 
 
 
303 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  42.3 
 
 
303 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  42.3 
 
 
303 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  41.97 
 
 
303 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  42.3 
 
 
303 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  41.1 
 
 
312 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  41.1 
 
 
312 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  43.55 
 
 
292 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  42.03 
 
 
299 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  42.3 
 
 
311 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  39.73 
 
 
303 aa  236  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  41.46 
 
 
293 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  41.67 
 
 
300 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  42.3 
 
 
303 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  42.86 
 
 
295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  43 
 
 
300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  43 
 
 
300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  43 
 
 
325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  41.14 
 
 
298 aa  235  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  41.92 
 
 
297 aa  235  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  41.52 
 
 
297 aa  235  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  40.53 
 
 
315 aa  235  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  41.22 
 
 
297 aa  235  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  40.75 
 
 
299 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  42.16 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  40.82 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  41.75 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6176  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.61 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  41.84 
 
 
302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  42 
 
 
300 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>