More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1677 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  100 
 
 		 317 aa  646    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  59.87 
 
 		 305 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0315  cysteine synthase  65.42 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.70232  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0720  cysteine synthase  64.55 
 
 		 321 aa  362  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  60.34 
 
 		 322 aa  344  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0952  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  62.08 
 
 		 309 aa  338  7e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0231  cysteine synthase B  56.85 
 
 		 321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0839  cysteine synthase B  52.67 
 
 		 316 aa  322  5e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0067092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3609  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  54.52 
 
 		 317 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.746552  normal  0.0138185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4179  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.56 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.703347  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  47.46 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  49.66 
 
 		 773 aa  271  9e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  48.15 
 
 		 308 aa  266  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  45.76 
 
 		 302 aa  256  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  47.62 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  46.28 
 
 		 771 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  46.76 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  46.94 
 
 		 299 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  46.21 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  43.2 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  46.6 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  45.89 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  45.89 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  46.08 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  48.11 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  45.89 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  43.2 
 
 		 354 aa  242  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  44.86 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  44.86 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  45.92 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  44.86 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  44.52 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  45.49 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  45.45 
 
 		 295 aa  235  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  45.55 
 
 		 293 aa  235  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2504  cysteine synthase B  45.61 
 
 		 295 aa  235  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  45.67 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  46.1 
 
 		 764 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  45.14 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  45.8 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  45.8 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  43.81 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  45.1 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  44.06 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  45.58 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6176  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.71 
 
 		 322 aa  232  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  46.02 
 
 		 300 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  45.02 
 
 		 296 aa  232  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  46.71 
 
 		 306 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  44.9 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  44.83 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  44.52 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  43.29 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  43.29 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  43.29 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  43.29 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  47.92 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  43.29 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  43.48 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  43.29 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  42.99 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  42.86 
 
 		 312 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  43.81 
 
 		 305 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  46.26 
 
 		 768 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  43.29 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  41.97 
 
 		 304 aa  229  7e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  44.33 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0346  cysteine synthase B  42.52 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  42.95 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  45.15 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  44.29 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  45.86 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1006  cysteine synthase B  45.21 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000380642  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  43.99 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  43.43 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  45.52 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  43.43 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  44.98 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3188  cysteine synthase B  43.99 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.124444  normal  0.617635 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  43.43 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  41.16 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  43.77 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  45.45 
 
 		 303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  44.29 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  43.1 
 
 		 303 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3011  cysteine synthase B  43.99 
 
 		 292 aa  225  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.421236  normal  0.0437724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3091  cysteine synthase B  43.64 
 
 		 292 aa  225  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134095  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  43.1 
 
 		 293 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3291  cysteine synthase B  44.67 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00528645  normal  0.163316 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0508  cysteine synthase B  43.79 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1100  cysteine synthase B  44.67 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00123647  normal  0.0556364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  43.94 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1285  cysteine synthase  46.05 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  44.48 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  44.33 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0380  cysteine synthase B  41.28 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  42.86 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  41.16 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  42.76 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  45.02 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>