More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0720 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0720  cysteine synthase  100 
 
 		 321 aa  643    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0315  cysteine synthase  91.8 
 
 		 318 aa  543  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.70232  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0952  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  75.49 
 
 		 309 aa  435  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  63.49 
 
 		 305 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  64.55 
 
 		 317 aa  388  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  55.59 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  50.51 
 
 		 773 aa  294  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0839  cysteine synthase B  51.5 
 
 		 316 aa  293  4e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0067092  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0231  cysteine synthase B  50 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3609  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.16 
 
 		 317 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.746552  normal  0.0138185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  45.42 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  47.8 
 
 		 302 aa  271  8.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6176  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.66 
 
 		 322 aa  268  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  47.12 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  47.26 
 
 		 295 aa  255  8e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  48.31 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  45.13 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  44.97 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  44.97 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  44.19 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  43.51 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  43.18 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  43.58 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  43.83 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  44.19 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  44.03 
 
 		 299 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  45.05 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  43.18 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4179  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47 
 
 		 313 aa  239  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.703347  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  43.51 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  43.87 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  43.87 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  43.87 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  43.87 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  43.87 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  43.87 
 
 		 303 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  43.24 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  45.61 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  43.55 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  45.55 
 
 		 771 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  44.26 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  44.56 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  44.56 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  43.34 
 
 		 292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  43.34 
 
 		 292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  43.34 
 
 		 292 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  44.3 
 
 		 312 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  45 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  45.89 
 
 		 764 aa  235  8e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  44.3 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  43.62 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  45.45 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  44.67 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  44.67 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  44.3 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  41.39 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  44.75 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  44.22 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  42.86 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  43.69 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  40.07 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  45.58 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  46.31 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  45.6 
 
 		 303 aa  233  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  40.4 
 
 		 294 aa  233  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  44.52 
 
 		 296 aa  232  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  43.96 
 
 		 312 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  42.28 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  43.67 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  43.54 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  41.32 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  42.86 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  42.42 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  43.54 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  43.62 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0508  cysteine synthase B  44.48 
 
 		 303 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  43.24 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0346  cysteine synthase B  40.65 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  41.56 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  42.18 
 
 		 293 aa  228  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  43.05 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  41.29 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  38.41 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  45.89 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1285  cysteine synthase  44.88 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  42.18 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  45.15 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  40.74 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  43.62 
 
 		 313 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  41.84 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  40.72 
 
 		 310 aa  226  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  43 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  42.52 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  43.81 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  41.89 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  42.71 
 
 		 303 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  41.84 
 
 		 300 aa  225  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  45 
 
 		 768 aa  225  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3091  cysteine synthase B  42.76 
 
 		 292 aa  225  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134095  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  43.88 
 
 		 300 aa  225  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>