More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0952 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0952  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
309 aa  625  1e-178  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0720  cysteine synthase  75.49 
 
 
321 aa  430  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814603  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0315  cysteine synthase  75.93 
 
 
318 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.70232  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  64.53 
 
 
305 aa  391  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  62.08 
 
 
317 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  55.44 
 
 
322 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  49.49 
 
 
302 aa  271  8.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  45.42 
 
 
318 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3609  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.99 
 
 
317 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.746552  normal  0.0138185 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0231  cysteine synthase B  48.99 
 
 
321 aa  265  8.999999999999999e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  48.3 
 
 
308 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0839  cysteine synthase B  48.32 
 
 
316 aa  264  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0067092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  46.64 
 
 
773 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  46.96 
 
 
295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  47.59 
 
 
294 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  47.59 
 
 
294 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6176  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.99 
 
 
322 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  45.24 
 
 
299 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  46.82 
 
 
764 aa  244  9e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  44.07 
 
 
301 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  44.07 
 
 
300 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  43.73 
 
 
301 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  47.37 
 
 
315 aa  240  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  43.97 
 
 
303 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  43.61 
 
 
303 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  43.28 
 
 
303 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  43.65 
 
 
303 aa  237  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  43.61 
 
 
303 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  44.7 
 
 
299 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  43.28 
 
 
303 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  43.65 
 
 
303 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  43.65 
 
 
303 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  43.65 
 
 
303 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  43.65 
 
 
303 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  43.65 
 
 
303 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  43.28 
 
 
303 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  43.65 
 
 
303 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  43.65 
 
 
303 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  44.41 
 
 
306 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  42.67 
 
 
301 aa  235  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  48.45 
 
 
308 aa  235  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  42.91 
 
 
297 aa  235  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  44.07 
 
 
300 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4179  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.18 
 
 
313 aa  235  8e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.703347  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  43.65 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  43.2 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  42.02 
 
 
304 aa  233  3e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  43.39 
 
 
300 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  46.9 
 
 
307 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0508  cysteine synthase B  45.73 
 
 
303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  42.71 
 
 
290 aa  232  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  43.05 
 
 
354 aa  232  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  43.43 
 
 
295 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  43.14 
 
 
299 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  41.47 
 
 
297 aa  231  8.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  45.18 
 
 
771 aa  231  9e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1285  cysteine synthase  46.6 
 
 
300 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  46.67 
 
 
768 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  40.48 
 
 
294 aa  231  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  42.81 
 
 
299 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  42.81 
 
 
312 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  42.81 
 
 
299 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  42.09 
 
 
300 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  43.2 
 
 
297 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  42.67 
 
 
312 aa  229  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  43.99 
 
 
300 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  42.81 
 
 
312 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  43.56 
 
 
309 aa  229  5e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  44.93 
 
 
296 aa  229  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  43.2 
 
 
295 aa  229  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  42.35 
 
 
312 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  45.7 
 
 
301 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  49.14 
 
 
308 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  43.1 
 
 
299 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  43.39 
 
 
300 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  44.22 
 
 
301 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  41.08 
 
 
313 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  45.21 
 
 
311 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  42.47 
 
 
312 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  41.3 
 
 
293 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  44.33 
 
 
300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  40.33 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  40.8 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  42.71 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  43.06 
 
 
297 aa  225  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  42.03 
 
 
300 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  42.47 
 
 
296 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  40.14 
 
 
294 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  42.72 
 
 
311 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  45.1 
 
 
303 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  41.28 
 
 
302 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  42.41 
 
 
292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  45.07 
 
 
306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  42.41 
 
 
292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  43.04 
 
 
310 aa  222  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  43.3 
 
 
300 aa  222  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  43.61 
 
 
302 aa  222  8e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  41.72 
 
 
293 aa  221  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  42.52 
 
 
303 aa  221  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  42.86 
 
 
303 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>