More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1314 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  100 
 
 		 322 aa  657    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  60.34 
 
 		 317 aa  364  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  59.25 
 
 		 305 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0839  cysteine synthase B  57.33 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0067092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0720  cysteine synthase  55.59 
 
 		 321 aa  325  7e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0231  cysteine synthase B  53.36 
 
 		 321 aa  323  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0315  cysteine synthase  54.93 
 
 		 318 aa  322  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.70232  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3609  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.16 
 
 		 317 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.746552  normal  0.0138185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  51.36 
 
 		 318 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0952  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  55.44 
 
 		 309 aa  305  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  50.51 
 
 		 771 aa  292  5e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  50.85 
 
 		 773 aa  292  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4179  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.75 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.703347  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  49.32 
 
 		 299 aa  288  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  48.98 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  50 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  47.96 
 
 		 308 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  49.83 
 
 		 307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  51.19 
 
 		 764 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  47.64 
 
 		 305 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  48.66 
 
 		 768 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  46.94 
 
 		 305 aa  255  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  45.82 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  45.55 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  44.86 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  44.22 
 
 		 299 aa  241  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  44.63 
 
 		 295 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  43.15 
 
 		 297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  43.49 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6176  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.08 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  45.24 
 
 		 294 aa  238  9e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  45.24 
 
 		 294 aa  238  9e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  43.15 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  43.15 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  43.15 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  43.15 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  43.15 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  43.15 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  43.15 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  44.81 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  45.87 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  42.81 
 
 		 295 aa  235  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  43.15 
 
 		 303 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  43.49 
 
 		 303 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  43.49 
 
 		 303 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  42.72 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  47.6 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  42.72 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  43.84 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  43.15 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  43.15 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  44.93 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  42.81 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  41.78 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  43.39 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  43 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  45.61 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  44.52 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  45.61 
 
 		 300 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  42.67 
 
 		 299 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  42.09 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  42.05 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  42.76 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  43.24 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  40.96 
 
 		 290 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  42.18 
 
 		 300 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  42.12 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  42.18 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  44.26 
 
 		 300 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  44.95 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0346  cysteine synthase B  40.78 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  41.97 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  42.86 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  42.41 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  45.12 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  41.44 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  42.52 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1698  cysteine synthase  44.7 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137932  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  41.72 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  41.5 
 
 		 296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1006  cysteine synthase B  42.47 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000380642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  42.91 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  42.47 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  42.52 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  41.86 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  41.06 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  42.86 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0380  cysteine synthase B  41.22 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  42.52 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  41.3 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  44.22 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  41.1 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  41.5 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  41.24 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  43.14 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  40.96 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  41.03 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  41.03 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  43.43 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  41.16 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>