More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0822 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  100 
 
 		 307 aa  626  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  75.25 
 
 		 308 aa  484  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  76.3 
 
 		 308 aa  461  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  76.62 
 
 		 308 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  69.7 
 
 		 299 aa  435  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  69.7 
 
 		 354 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  69.33 
 
 		 302 aa  428  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  71.38 
 
 		 305 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  68.21 
 
 		 305 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  53.04 
 
 		 773 aa  333  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  53.85 
 
 		 318 aa  332  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  55.1 
 
 		 771 aa  317  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  52.9 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  52.74 
 
 		 764 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  50.17 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  50.17 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  49.66 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  50.68 
 
 		 299 aa  281  9e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  48.98 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  48.81 
 
 		 297 aa  278  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  48.24 
 
 		 768 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  47.8 
 
 		 313 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  48.32 
 
 		 295 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  48.81 
 
 		 300 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  47.99 
 
 		 303 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  47.99 
 
 		 303 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  47.99 
 
 		 300 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  47.99 
 
 		 300 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  47.99 
 
 		 303 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  47.99 
 
 		 303 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  47.99 
 
 		 303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  47.65 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  48.63 
 
 		 297 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  46.98 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  46.64 
 
 		 300 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  46.64 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  49.83 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  46.64 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  48.65 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  46.26 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  45.97 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  45.97 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  45.97 
 
 		 325 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  48.43 
 
 		 291 aa  268  8e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  46.58 
 
 		 298 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  45.89 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  48.97 
 
 		 303 aa  267  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  46.08 
 
 		 294 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  47.64 
 
 		 300 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  45.89 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  45.89 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  45.89 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  46.76 
 
 		 297 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  46.58 
 
 		 303 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  45.89 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  46.23 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  45.89 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  45.89 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  46.23 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  46.92 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  46.23 
 
 		 312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  46.58 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  46.23 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  46.23 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  47.3 
 
 		 315 aa  266  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  46.42 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  45.39 
 
 		 301 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  45.55 
 
 		 303 aa  265  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  46.23 
 
 		 303 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  46.92 
 
 		 295 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  47 
 
 		 299 aa  265  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  45.55 
 
 		 303 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  47.26 
 
 		 290 aa  265  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0231  cysteine synthase B  52.05 
 
 		 321 aa  265  8e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  45.21 
 
 		 299 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  46.13 
 
 		 300 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  45.89 
 
 		 312 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  44.86 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  47.1 
 
 		 296 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  45.92 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  45.95 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  46.23 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  44.86 
 
 		 293 aa  261  8.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  46.28 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  48.11 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  46.31 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  45.79 
 
 		 300 aa  258  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  46.28 
 
 		 300 aa  258  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  45.95 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  45.27 
 
 		 301 aa  258  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  45.95 
 
 		 300 aa  258  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  44.59 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  45.89 
 
 		 293 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  44.93 
 
 		 315 aa  256  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  44.86 
 
 		 303 aa  256  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  47.3 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0508  cysteine synthase B  46.62 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  44.18 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  44.93 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  44.18 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>