More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0746 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  100 
 
 		 305 aa  617  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0315  cysteine synthase  63.25 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.70232  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  59.87 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0720  cysteine synthase  63.49 
 
 		 321 aa  378  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0952  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  64.53 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  59.25 
 
 		 322 aa  347  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3609  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.31 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.746552  normal  0.0138185 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0231  cysteine synthase B  54.3 
 
 		 321 aa  311  5.999999999999999e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0839  cysteine synthase B  54.64 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0067092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  53.58 
 
 		 302 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  52.04 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  51.03 
 
 		 299 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  51.03 
 
 		 354 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  48.14 
 
 		 773 aa  287  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  52.9 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  46.6 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4179  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.34 
 
 		 313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.703347  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  51.19 
 
 		 771 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6176  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.15 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  50.51 
 
 		 305 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  50 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  49.66 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  50.69 
 
 		 764 aa  266  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  47.28 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  47.28 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  46.42 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  46.44 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  46.44 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  46.26 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  45.58 
 
 		 312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  45.52 
 
 		 297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  45.58 
 
 		 312 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  45.58 
 
 		 299 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  45.58 
 
 		 312 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  44.75 
 
 		 299 aa  252  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  44.9 
 
 		 299 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  46.42 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  44.9 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  48.82 
 
 		 768 aa  250  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  50.34 
 
 		 308 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  44.56 
 
 		 299 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  45.64 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  45.97 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  43.39 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  45.95 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  44.56 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  44.41 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0508  cysteine synthase B  45.33 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  45.61 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  46.28 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  44.97 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  44.93 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  44.71 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  42.71 
 
 		 293 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  43.34 
 
 		 295 aa  242  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  44.59 
 
 		 301 aa  241  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  44.59 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  44.59 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  43.54 
 
 		 313 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  45.61 
 
 		 301 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  44.03 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  40.66 
 
 		 298 aa  237  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  44.19 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  43.92 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  43.92 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  42.23 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  43.58 
 
 		 303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  42.95 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  43.92 
 
 		 300 aa  235  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  43.24 
 
 		 301 aa  235  9e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  43.58 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  43.58 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  45.48 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  43.58 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  43.58 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  41.48 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  43.58 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  43.58 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  43.24 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  41.02 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  43.58 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  44.48 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  41.02 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  42.77 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2221  cysteine synthase B  45.42 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  41.55 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  41.02 
 
 		 292 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  43 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  41.22 
 
 		 294 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  42.32 
 
 		 298 aa  232  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  42.03 
 
 		 303 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  42.91 
 
 		 300 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  42.03 
 
 		 303 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  40.68 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  43.81 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  43.81 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  42.03 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  43.24 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  43.81 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  43.05 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>