More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4179 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4179  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 313 aa  634    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.703347  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3609  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  57.51 
 
 		 317 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.746552  normal  0.0138185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  53.56 
 
 		 317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  51.34 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  53.75 
 
 		 322 aa  291  9e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0231  cysteine synthase B  50.17 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  47.08 
 
 		 308 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0839  cysteine synthase B  48.66 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0067092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  48.28 
 
 		 299 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  47.93 
 
 		 354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  48.45 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  48.63 
 
 		 305 aa  238  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  48.08 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0315  cysteine synthase  45.97 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.70232  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  47.42 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  43.49 
 
 		 318 aa  235  9e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  48.78 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0720  cysteine synthase  47 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0952  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.18 
 
 		 309 aa  232  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6176  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.92 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  48.43 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  41.64 
 
 		 773 aa  219  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  41.16 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  41.16 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  41.16 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  41.16 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  41.16 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  43.15 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  41.16 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  41.16 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  41.16 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  41.16 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  43.15 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  40.82 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  40.82 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  42.51 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  41.78 
 
 		 295 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  41.84 
 
 		 312 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  41.84 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  41.84 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  42.16 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  42.51 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  42.86 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  42.16 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  41.46 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  41.5 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  41.84 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  41.46 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  40.88 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  41.44 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  41.81 
 
 		 303 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  41.92 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  41.1 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  41.67 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  38 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  41.67 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  41.44 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  42.86 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  43.2 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  41.22 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  41.67 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  41.41 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  40.07 
 
 		 295 aa  205  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  41.5 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  40.14 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  40.82 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  40.97 
 
 		 293 aa  203  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1285  cysteine synthase  41.38 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  40.82 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  41.69 
 
 		 768 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  40.94 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  40.07 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  40.13 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  38.85 
 
 		 291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  40.14 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  39.8 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  40.54 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  37.16 
 
 		 290 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  39.73 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  39.73 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  38.78 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  37.34 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  41.08 
 
 		 300 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  40.14 
 
 		 771 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  39.07 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  40.13 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  39.86 
 
 		 300 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  38.94 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  36.62 
 
 		 312 aa  192  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  39.26 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  38.01 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  39.73 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  41.78 
 
 		 764 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2239  cysteine synthase B  39.93 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  39.73 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  39.61 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  39.73 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  38.56 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  39.73 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  36.94 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>