More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1011 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1011  cysteine synthase  100 
 
 		 316 aa  634    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29160  cysteine synthase  86.08 
 
 		 316 aa  556  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  78.03 
 
 		 315 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  77.71 
 
 		 315 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  78.34 
 
 		 315 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  76.75 
 
 		 315 aa  501  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  76.75 
 
 		 315 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  77.39 
 
 		 315 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1698  cysteine synthase  77.92 
 
 		 317 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137932  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  75.32 
 
 		 316 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1728  cysteine synthase B  76.11 
 
 		 315 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1312  cysteine synthase  76.18 
 
 		 320 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3834  cysteine synthase  74.92 
 
 		 323 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.124032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  71.47 
 
 		 326 aa  471  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3848  cysteine synthase  74.61 
 
 		 323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3922  cysteine synthase  74.61 
 
 		 323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2354  cysteine synthase  75 
 
 		 324 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1102  cysteine synthase  75.39 
 
 		 321 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5652  cysteine synthase  75.48 
 
 		 315 aa  461  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.397691  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4291  cysteine synthases  75.31 
 
 		 320 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1291  cysteine synthase  75.3 
 
 		 328 aa  458  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0868  cysteine synthase  73.57 
 
 		 315 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0991  cysteine synthase  74.14 
 
 		 337 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145876  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1541  cysteine synthase  70.25 
 
 		 316 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1846  cysteine synthase  52.55 
 
 		 323 aa  288  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  47.46 
 
 		 302 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  45.03 
 
 		 300 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  45.03 
 
 		 300 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  45.03 
 
 		 300 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  45.03 
 
 		 300 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  45.03 
 
 		 325 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  44.7 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  45.45 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  44.37 
 
 		 303 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  44.44 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  44.04 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  44.04 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  44.04 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  44.04 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  44.04 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  44.04 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  45.18 
 
 		 300 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  44.85 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  43.71 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  43.38 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  44.85 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  44.85 
 
 		 300 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  45.51 
 
 		 311 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0990  cysteine synthase B  44.04 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2993  cysteine synthase B  44.04 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  hitchhiker  0.00110964 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  43.88 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  43.75 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  43.88 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  44.19 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  41.72 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  43.75 
 
 		 301 aa  238  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  44.19 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  44.85 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  44.67 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  42.72 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  44.15 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  41.12 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  45.58 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  43.52 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  43.09 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  43.19 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  41.91 
 
 		 773 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  45.58 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  44.11 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  46.28 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  43.1 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  43.81 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  43.81 
 
 		 298 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  41.64 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  41.61 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  40.07 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  41.06 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  42.43 
 
 		 301 aa  225  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  41.28 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  39.47 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2221  cysteine synthase B  43.77 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  40.07 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  42.19 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  41.61 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  41.28 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  41.28 
 
 		 312 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  40.27 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  41.53 
 
 		 302 aa  221  9e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  40.94 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  40.98 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  40.98 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  41.28 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  42.14 
 
 		 768 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  44.88 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  38.82 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  40.6 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  41.5 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  41.58 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  45.79 
 
 		 305 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  41.28 
 
 		 313 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>