More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1312 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1312  cysteine synthase  100 
 
 		 320 aa  647    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  80 
 
 		 315 aa  528  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1728  cysteine synthase B  80.31 
 
 		 315 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  78.12 
 
 		 315 aa  510  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  77.81 
 
 		 315 aa  507  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  78.12 
 
 		 315 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  76.25 
 
 		 315 aa  501  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  77.5 
 
 		 315 aa  500  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  75.86 
 
 		 316 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29160  cysteine synthase  75.86 
 
 		 316 aa  491  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1698  cysteine synthase  75.62 
 
 		 317 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137932  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  74.69 
 
 		 326 aa  478  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5652  cysteine synthase  76.25 
 
 		 315 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.397691  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1011  cysteine synthase  76.18 
 
 		 316 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1291  cysteine synthase  75.46 
 
 		 328 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0868  cysteine synthase  73.44 
 
 		 315 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2354  cysteine synthase  73.29 
 
 		 324 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4291  cysteine synthases  74.29 
 
 		 320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3834  cysteine synthase  73.21 
 
 		 323 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.124032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3848  cysteine synthase  72.9 
 
 		 323 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3922  cysteine synthase  72.9 
 
 		 323 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1102  cysteine synthase  71.16 
 
 		 321 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0991  cysteine synthase  71.47 
 
 		 337 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145876  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1541  cysteine synthase  66.77 
 
 		 316 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1846  cysteine synthase  53.29 
 
 		 323 aa  288  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  46.69 
 
 		 295 aa  255  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  46.08 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  46.05 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  45.72 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  45.39 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  44.01 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  44.01 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  44.01 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  44.01 
 
 		 303 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  46.25 
 
 		 299 aa  242  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  45.07 
 
 		 300 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  44.01 
 
 		 303 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  44.01 
 
 		 303 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  44.01 
 
 		 303 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  44.01 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  44.01 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  43.69 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  43.69 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  45.72 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  42.72 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  43.69 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  44.44 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  43.37 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  44.66 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  45.03 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  42.72 
 
 		 300 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0990  cysteine synthase B  42.72 
 
 		 300 aa  235  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  43.75 
 
 		 311 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  41.42 
 
 		 300 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2993  cysteine synthase B  42.72 
 
 		 300 aa  235  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  hitchhiker  0.00110964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  44.63 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  44.37 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  42.72 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  42.43 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  44.3 
 
 		 301 aa  232  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  44.7 
 
 		 301 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  43.42 
 
 		 300 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  42.11 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  42.76 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  43.19 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  42.76 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  43.75 
 
 		 299 aa  228  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  43.71 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  44.08 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  40.84 
 
 		 304 aa  225  8e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  40.66 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  44.04 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  42.72 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  42.81 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  42.47 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  43.46 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  42.47 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  42.47 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  42.47 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  42.47 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  42.47 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  42.47 
 
 		 303 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  42.47 
 
 		 303 aa  222  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  41.86 
 
 		 303 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  41.86 
 
 		 303 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  41.53 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  47.32 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2221  cysteine synthase B  45.95 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  40.33 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  41.69 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  41.53 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  42.14 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  41.69 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  44.85 
 
 		 307 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  41.2 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  41.25 
 
 		 773 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  40 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  39.48 
 
 		 312 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  42.05 
 
 		 303 aa  218  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0508  cysteine synthase B  42.35 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>