More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0868 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0868  cysteine synthase  100 
 
 		 315 aa  637    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5652  cysteine synthase  91.75 
 
 		 315 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.397691  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  82.22 
 
 		 315 aa  535  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  81.27 
 
 		 315 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  78.66 
 
 		 316 aa  512  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1728  cysteine synthase B  79.05 
 
 		 315 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  77.78 
 
 		 315 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  78.73 
 
 		 315 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  75.87 
 
 		 315 aa  494  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1698  cysteine synthase  77.14 
 
 		 317 aa  491  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137932  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  73.97 
 
 		 315 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1312  cysteine synthase  73.44 
 
 		 320 aa  475  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29160  cysteine synthase  71.97 
 
 		 316 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  71.91 
 
 		 326 aa  458  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4291  cysteine synthases  73.58 
 
 		 320 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3834  cysteine synthase  71.96 
 
 		 323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.124032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2354  cysteine synthase  72.98 
 
 		 324 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1011  cysteine synthase  73.57 
 
 		 316 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3848  cysteine synthase  71.96 
 
 		 323 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1102  cysteine synthase  71.16 
 
 		 321 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3922  cysteine synthase  71.96 
 
 		 323 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0991  cysteine synthase  71.79 
 
 		 337 aa  431  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145876  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1291  cysteine synthase  71.47 
 
 		 328 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1541  cysteine synthase  68.15 
 
 		 316 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1846  cysteine synthase  54.14 
 
 		 323 aa  305  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  49.01 
 
 		 296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  48.15 
 
 		 295 aa  265  8e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  47.37 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  47.37 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  47.37 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  47.04 
 
 		 300 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  47.04 
 
 		 300 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  46.64 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  45.72 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  44.88 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  46.8 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  47.18 
 
 		 299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  45.54 
 
 		 300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  45.87 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  44.88 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  45.39 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  45.21 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  45.21 
 
 		 300 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  45.85 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  45.39 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  47.47 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  45.39 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  46.05 
 
 		 300 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  44.22 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  46.39 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  45.39 
 
 		 303 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  45.39 
 
 		 303 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  45.39 
 
 		 303 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  45.39 
 
 		 303 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  45.36 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  45.51 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  44.74 
 
 		 303 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  43.23 
 
 		 300 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  45.24 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  45.24 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  44.22 
 
 		 773 aa  245  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  46.18 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  45.67 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  43.52 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  45.15 
 
 		 299 aa  242  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  43.75 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  45.39 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  45.73 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  42.86 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  42.52 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2221  cysteine synthase B  46.46 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  43.81 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  44.15 
 
 		 313 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0990  cysteine synthase B  44.08 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2993  cysteine synthase B  44.08 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  hitchhiker  0.00110964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  45.03 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  44.48 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  46.28 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  45.79 
 
 		 305 aa  235  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  41.58 
 
 		 300 aa  235  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  43.33 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  42.68 
 
 		 315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  42.47 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  41.5 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  42.81 
 
 		 312 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  47.04 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  44.78 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  46.6 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  43.56 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  42.47 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  43.48 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  46.39 
 
 		 764 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  42.14 
 
 		 312 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  43.77 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  43.96 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  43.48 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  42.81 
 
 		 301 aa  229  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  41.41 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  41.41 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  41.41 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>