More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0925 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  74 
 
 
464 aa  657    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  73.31 
 
 
464 aa  657    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  72.53 
 
 
455 aa  673    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  100 
 
 
468 aa  932    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  72.46 
 
 
464 aa  648    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  72.3 
 
 
464 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  79.4 
 
 
468 aa  720    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  73.57 
 
 
460 aa  674    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  78.76 
 
 
465 aa  688    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  73.94 
 
 
464 aa  657    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  73.09 
 
 
464 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  73.09 
 
 
464 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  71.67 
 
 
454 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  70.51 
 
 
457 aa  631  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  70.45 
 
 
456 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  66.67 
 
 
461 aa  624  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  70.79 
 
 
463 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  67.95 
 
 
461 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  68.52 
 
 
456 aa  615  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  68.95 
 
 
456 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  69.08 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  67.24 
 
 
455 aa  596  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  66.52 
 
 
456 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  68.74 
 
 
462 aa  591  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  68.02 
 
 
456 aa  588  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  65.31 
 
 
454 aa  585  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  65.82 
 
 
458 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  65.31 
 
 
455 aa  567  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  63.19 
 
 
463 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  61.28 
 
 
462 aa  508  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  56.1 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  46.58 
 
 
461 aa  432  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  70 
 
 
521 aa  429  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  53.96 
 
 
465 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  45.49 
 
 
458 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  46.19 
 
 
459 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.44 
 
 
459 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.57 
 
 
459 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.77 
 
 
459 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  44.97 
 
 
463 aa  363  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  57.57 
 
 
355 aa  359  6e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.51 
 
 
453 aa  349  6e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.85 
 
 
326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  39.58 
 
 
453 aa  338  9e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  52.23 
 
 
326 aa  328  9e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  51.18 
 
 
332 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.92 
 
 
496 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.69 
 
 
465 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  45.29 
 
 
326 aa  301  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  40.26 
 
 
459 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  37.89 
 
 
464 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.55 
 
 
456 aa  286  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  39.27 
 
 
479 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  37.18 
 
 
494 aa  281  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  44.18 
 
 
345 aa  280  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  38.81 
 
 
457 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  38.81 
 
 
457 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.42 
 
 
346 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  45.57 
 
 
316 aa  270  4e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  45.87 
 
 
316 aa  270  5.9999999999999995e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  34.94 
 
 
456 aa  270  5.9999999999999995e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.73 
 
 
456 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  40.17 
 
 
469 aa  268  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  38.59 
 
 
454 aa  266  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.47 
 
 
333 aa  264  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  33.61 
 
 
466 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.34 
 
 
461 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0289  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.13 
 
 
510 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16012 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  40.34 
 
 
464 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  36.95 
 
 
535 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.13 
 
 
461 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.59 
 
 
479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.69 
 
 
457 aa  254  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.15 
 
 
455 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  33.26 
 
 
457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  36.02 
 
 
456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  32.48 
 
 
459 aa  246  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  44.34 
 
 
311 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  37.85 
 
 
302 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3855  cysteine synthase  47.96 
 
 
344 aa  244  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  42.12 
 
 
340 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  44.1 
 
 
316 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  42.46 
 
 
311 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.56 
 
 
307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  43.79 
 
 
316 aa  236  9e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  42.36 
 
 
312 aa  236  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  31.84 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  47.17 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  42.68 
 
 
331 aa  234  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  44.17 
 
 
309 aa  233  5e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  42.36 
 
 
310 aa  232  9e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  44.75 
 
 
310 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.46 
 
 
307 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  42.2 
 
 
372 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  40.45 
 
 
310 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  40.45 
 
 
310 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  41.01 
 
 
312 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  39.19 
 
 
302 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  42.45 
 
 
304 aa  229  9e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  42.5 
 
 
327 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>