More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2126 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  66.08 
 
 
457 aa  635    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
457 aa  945    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  72.21 
 
 
459 aa  697    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2553  Cysteine synthase  77.68 
 
 
457 aa  717    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  76.59 
 
 
459 aa  733    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  64.33 
 
 
466 aa  624  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1634  CBS  65.3 
 
 
457 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.35 
 
 
459 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  34.9 
 
 
459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.59 
 
 
459 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.9 
 
 
459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.58 
 
 
453 aa  273  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  35.27 
 
 
463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  33.94 
 
 
461 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  44.52 
 
 
332 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  32.53 
 
 
453 aa  265  8.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  35.19 
 
 
455 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  35.22 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  34.43 
 
 
469 aa  253  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  32.07 
 
 
458 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  34.64 
 
 
464 aa  250  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  34.2 
 
 
454 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  34.29 
 
 
464 aa  250  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  34.29 
 
 
464 aa  250  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.08 
 
 
496 aa  249  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  34.07 
 
 
464 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  36.11 
 
 
458 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  35.51 
 
 
456 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  35 
 
 
460 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  34.85 
 
 
456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  33.69 
 
 
464 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  33.69 
 
 
468 aa  246  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  34.06 
 
 
456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  34.96 
 
 
455 aa  244  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  33.7 
 
 
464 aa  243  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  31.26 
 
 
461 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  34.07 
 
 
456 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  34.86 
 
 
464 aa  242  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  34.65 
 
 
457 aa  240  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  34.04 
 
 
468 aa  239  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  34.36 
 
 
462 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  32.39 
 
 
461 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  33.41 
 
 
464 aa  236  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  33.33 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  35.12 
 
 
456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  35 
 
 
462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  34.34 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  32.17 
 
 
463 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  32.76 
 
 
455 aa  233  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  32.74 
 
 
459 aa  232  9e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  32.1 
 
 
479 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.78 
 
 
333 aa  216  5e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  35 
 
 
326 aa  216  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  32.29 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  32.29 
 
 
457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  40.63 
 
 
355 aa  213  7.999999999999999e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.94 
 
 
326 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  30.62 
 
 
521 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.34 
 
 
326 aa  206  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  30.95 
 
 
494 aa  202  9e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  31.91 
 
 
465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.52 
 
 
465 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.29 
 
 
346 aa  199  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  33.23 
 
 
345 aa  198  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  35.65 
 
 
316 aa  195  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  35.33 
 
 
316 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  35.69 
 
 
340 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  34.16 
 
 
324 aa  193  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  36.54 
 
 
327 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.87 
 
 
479 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  33.12 
 
 
324 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  34.3 
 
 
324 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.96 
 
 
455 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  31.37 
 
 
464 aa  190  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  30.24 
 
 
456 aa  189  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.44 
 
 
456 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  29.98 
 
 
469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  30.33 
 
 
464 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.77 
 
 
461 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  29.54 
 
 
454 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  33.96 
 
 
334 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.77 
 
 
461 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  37.13 
 
 
311 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  40.26 
 
 
308 aa  179  9e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  33.23 
 
 
325 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  33.97 
 
 
326 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.01 
 
 
325 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  31.68 
 
 
338 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.8 
 
 
328 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  32.7 
 
 
324 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.41 
 
 
456 aa  176  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  36.16 
 
 
304 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  32.4 
 
 
324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  32.91 
 
 
323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2922  cysteine synthase A  34.29 
 
 
336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  28.19 
 
 
456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  32.91 
 
 
323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  34.95 
 
 
308 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  32.92 
 
 
331 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  32.92 
 
 
345 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>