More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2178 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  100 
 
 		 466 aa  966    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  73.96 
 
 		 457 aa  711    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  64.11 
 
 		 459 aa  614  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  64.33 
 
 		 457 aa  616  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  60.18 
 
 		 459 aa  580  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2553  Cysteine synthase  63.02 
 
 		 457 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1634  CBS  56.19 
 
 		 457 aa  497  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.67 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.45 
 
 		 459 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  35.45 
 
 		 459 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.89 
 
 		 453 aa  293  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  34.14 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  36.44 
 
 		 469 aa  286  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.14 
 
 		 459 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  35.4 
 
 		 463 aa  286  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  32.52 
 
 		 461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  34.7 
 
 		 455 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  37.17 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  35.34 
 
 		 464 aa  274  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  36.3 
 
 		 460 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  35.46 
 
 		 455 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  37.04 
 
 		 458 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  35.27 
 
 		 456 aa  273  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  34.32 
 
 		 461 aa  272  9e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  39.88 
 
 		 332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.86 
 
 		 496 aa  269  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  34.71 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  36.26 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  34.84 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  36.32 
 
 		 456 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  35.13 
 
 		 464 aa  266  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  33.26 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  35.28 
 
 		 462 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  34.92 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  34.72 
 
 		 464 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  32.17 
 
 		 458 aa  259  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  35.48 
 
 		 463 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  34.93 
 
 		 463 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  34.72 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  36.54 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  33.12 
 
 		 464 aa  257  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  33.12 
 
 		 464 aa  257  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  32.91 
 
 		 464 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  34.34 
 
 		 457 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  35.22 
 
 		 462 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  33.4 
 
 		 468 aa  251  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.94 
 
 		 326 aa  250  4e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  33.61 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  33.12 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  32.84 
 
 		 465 aa  236  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  35.29 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.32 
 
 		 326 aa  230  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  31.14 
 
 		 459 aa  229  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  36.99 
 
 		 340 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  32.52 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.5 
 
 		 479 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  32.82 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  38.92 
 
 		 355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  32.96 
 
 		 456 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  35.09 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  32.46 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.78 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  32.37 
 
 		 457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  31.32 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.13 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  37.26 
 
 		 327 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  38.65 
 
 		 521 aa  216  8e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  29.38 
 
 		 494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.62 
 
 		 346 aa  209  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  30.85 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.07 
 
 		 461 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.11 
 
 		 455 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.85 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.56 
 
 		 456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  28.44 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  34.26 
 
 		 324 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.05 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  28.82 
 
 		 456 aa  189  7e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  35.02 
 
 		 325 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  32.09 
 
 		 316 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  35.53 
 
 		 323 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  35.53 
 
 		 323 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  33.65 
 
 		 324 aa  187  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.65 
 
 		 328 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  31.78 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  33.65 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  37.33 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  33.33 
 
 		 338 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  35.19 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  34.6 
 
 		 326 aa  183  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  28.8 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  32.55 
 
 		 302 aa  181  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  32.81 
 
 		 324 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.03 
 
 		 325 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  33.33 
 
 		 334 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  28.67 
 
 		 535 aa  176  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  34.62 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  31.95 
 
 		 331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  32.55 
 
 		 312 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  32.44 
 
 		 315 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>