More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3667 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 496 aa  1028    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  64 
 
 		 453 aa  591  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  61.95 
 
 		 453 aa  581  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  56.55 
 
 		 458 aa  548  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  67.79 
 
 		 326 aa  491  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  52.65 
 
 		 345 aa  393  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  54.63 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  53.4 
 
 		 346 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  44.54 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  44.98 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.1 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.89 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  42.2 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.04 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  44.57 
 
 		 463 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  51.7 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  42.7 
 
 		 456 aa  355  6.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  43.56 
 
 		 455 aa  355  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  43.26 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  42.61 
 
 		 455 aa  355  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  44.49 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  42.7 
 
 		 456 aa  353  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  41.94 
 
 		 456 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  42.37 
 
 		 456 aa  350  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  43.35 
 
 		 464 aa  349  8e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  42.15 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  41.42 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  41.38 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  40.77 
 
 		 458 aa  336  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  45.23 
 
 		 461 aa  329  7e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  45.67 
 
 		 461 aa  328  9e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  41.94 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  40.47 
 
 		 462 aa  326  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  42.04 
 
 		 464 aa  325  9e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  40 
 
 		 463 aa  322  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  39.92 
 
 		 468 aa  322  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  39.87 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  42.52 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  40.47 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  38.44 
 
 		 465 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  41.67 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  41.45 
 
 		 469 aa  317  5e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  41.45 
 
 		 464 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  41.45 
 
 		 464 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  40.38 
 
 		 460 aa  313  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  41.24 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50 
 
 		 326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  36.89 
 
 		 457 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  37.25 
 
 		 457 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  40.29 
 
 		 494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.59 
 
 		 465 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  35.54 
 
 		 459 aa  299  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  36.81 
 
 		 479 aa  299  9e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  47.56 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  47.42 
 
 		 521 aa  298  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  40.21 
 
 		 464 aa  295  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  39.24 
 
 		 465 aa  292  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  47.66 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  42.28 
 
 		 324 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  47.98 
 
 		 316 aa  290  6e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  43.83 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  43.69 
 
 		 325 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  41.54 
 
 		 324 aa  287  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  44.17 
 
 		 323 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  44.17 
 
 		 323 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.83 
 
 		 328 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  41.36 
 
 		 331 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  44.48 
 
 		 340 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  43.99 
 
 		 326 aa  282  8.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.8 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  31.79 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  41.46 
 
 		 324 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  47.29 
 
 		 355 aa  281  3e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  33.98 
 
 		 464 aa  279  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  33.26 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.92 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  39.81 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.58 
 
 		 479 aa  276  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  35.48 
 
 		 456 aa  275  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.65 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  41.64 
 
 		 325 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  32.68 
 
 		 459 aa  272  9e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  39.88 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  38.82 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  40.43 
 
 		 334 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.59 
 
 		 343 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.2 
 
 		 343 aa  268  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  35.62 
 
 		 535 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  34.96 
 
 		 464 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.03 
 
 		 461 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.59 
 
 		 461 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  30.68 
 
 		 457 aa  263  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  41.32 
 
 		 332 aa  263  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.08 
 
 		 457 aa  258  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05880  cysteine synthase, putative  40.48 
 
 		 405 aa  256  6e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254646  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1391  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.88 
 
 		 348 aa  256  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  39.76 
 
 		 346 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  40.06 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2323  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.94 
 
 		 343 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  39.76 
 
 		 345 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>