More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2564 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  91.55 
 
 		 345 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  94.2 
 
 		 346 aa  664    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  100 
 
 		 345 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  85.71 
 
 		 366 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4677  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  78.64 
 
 		 342 aa  557  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  76.63 
 
 		 343 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2140  cysteine synthase A  75.07 
 
 		 342 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1424  cysteine synthase A  74.63 
 
 		 346 aa  534  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1053  cysteine synthase A  74.04 
 
 		 342 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1018  cysteine synthase A  73.75 
 
 		 342 aa  531  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1617  cysteine synthase A  73.91 
 
 		 345 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1438  cysteine synthase A  73.47 
 
 		 345 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536284  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1363  cysteine synthase A  74.05 
 
 		 346 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  75.15 
 
 		 343 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  75.07 
 
 		 352 aa  524  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.816329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  75.6 
 
 		 332 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3861  cysteine synthase A  72.24 
 
 		 343 aa  517  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2314  putative cysteine synthase A  70.97 
 
 		 345 aa  512  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1439  cysteine synthase A  71.18 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159205  normal  0.177571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1993  cysteine synthase A  72.11 
 
 		 341 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1879  cysteine synthase  73.33 
 
 		 345 aa  507  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0821  cysteine synthase A  67.73 
 
 		 344 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0212219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2922  cysteine synthase A  71.78 
 
 		 336 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0819  cysteine synthase A  68.59 
 
 		 344 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2147  cysteine synthase A  67.73 
 
 		 344 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  68.5 
 
 		 352 aa  495  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  67.35 
 
 		 344 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1493  cysteine synthase A  69.33 
 
 		 333 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2323  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  68.64 
 
 		 343 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1391  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  67.88 
 
 		 348 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2067  cysteine synthase A  67.05 
 
 		 346 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1666  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  67.27 
 
 		 348 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1100  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  67.68 
 
 		 349 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1387  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  66.97 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  65.35 
 
 		 328 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  64.55 
 
 		 372 aa  433  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0343  cysteine synthase A  63.03 
 
 		 340 aa  433  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  65.24 
 
 		 324 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1275  cysteine synthase A  64.56 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.175602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1489  cysteine synthase A  66.87 
 
 		 335 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.926588  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  63.8 
 
 		 326 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  62.88 
 
 		 323 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  65.26 
 
 		 338 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  62.88 
 
 		 323 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  60.43 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  62.27 
 
 		 324 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  63.5 
 
 		 324 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  61.96 
 
 		 324 aa  411  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  61.21 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1616  cysteine synthase A  61.45 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  59.82 
 
 		 332 aa  408  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  61.45 
 
 		 332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  62.35 
 
 		 325 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  61.96 
 
 		 325 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  60.74 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  61.77 
 
 		 331 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1893  cysteine synthase A  59.82 
 
 		 326 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.484332  normal  0.0992226 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05880  cysteine synthase, putative  54.43 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254646  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08057  Cysteine synthase (CSase)(EC 2.5.1.47)(O-acetylserine sulfhydrylase)(O-acetylserine (thiol)-lyase)(OAS-TL) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P50867]  52.38 
 
 		 370 aa  334  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59891  cysteine synthase (CYSK1)  52.87 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3653  cysteine synthase A  47.53 
 
 		 370 aa  301  9e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0676  cysteine synthase A  47.35 
 
 		 362 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  41.64 
 
 		 459 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.95 
 
 		 459 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.64 
 
 		 459 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.98 
 
 		 453 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.73 
 
 		 459 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  41.98 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  39.69 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41218  predicted protein  39.71 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  39.83 
 
 		 463 aa  242  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  40.69 
 
 		 332 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.76 
 
 		 496 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.77 
 
 		 479 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  39.94 
 
 		 453 aa  233  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01513  hypothetical transmembrane protein (Eurofung)  41.14 
 
 		 428 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  41.43 
 
 		 457 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02520  cysteine synthase, putative  40.32 
 
 		 458 aa  229  5e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  40.41 
 
 		 457 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.14 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  39.29 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  40.68 
 
 		 479 aa  222  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  39.32 
 
 		 461 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  40.94 
 
 		 327 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  41.21 
 
 		 456 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  40.43 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  39.83 
 
 		 521 aa  216  5e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1362  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.89 
 
 		 319 aa  215  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  36.09 
 
 		 340 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  40 
 
 		 455 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.9 
 
 		 455 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  40.25 
 
 		 456 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30734  cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  39.81 
 
 		 392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.207324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.31 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54915  eukaryotic cysteine synthase  40.36 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  40.26 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  40.25 
 
 		 456 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  43.44 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  40 
 
 		 455 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  36.81 
 
 		 464 aa  208  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>