More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0819 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0819  cysteine synthase A  100 
 
 
344 aa  702    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0821  cysteine synthase A  92.73 
 
 
344 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0212219  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2147  cysteine synthase A  92.73 
 
 
344 aa  660    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3861  cysteine synthase A  83.67 
 
 
343 aa  598  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1439  cysteine synthase A  81.98 
 
 
394 aa  591  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159205  normal  0.177571 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2314  putative cysteine synthase A  81.1 
 
 
345 aa  586  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1993  cysteine synthase A  77.84 
 
 
341 aa  557  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4677  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  75.95 
 
 
342 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_004310  BR1053  cysteine synthase A  76.38 
 
 
342 aa  517  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1018  cysteine synthase A  76.07 
 
 
342 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1438  cysteine synthase A  72.92 
 
 
345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536284  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  70.97 
 
 
366 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2140  cysteine synthase A  74.92 
 
 
342 aa  511  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1617  cysteine synthase A  72.02 
 
 
345 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1363  cysteine synthase A  72.84 
 
 
346 aa  510  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  76.81 
 
 
332 aa  508  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  74.17 
 
 
343 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2922  cysteine synthase A  75.31 
 
 
336 aa  498  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  68.59 
 
 
345 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  70.96 
 
 
345 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1424  cysteine synthase A  69.48 
 
 
346 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348736  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  69.59 
 
 
346 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1879  cysteine synthase  75 
 
 
345 aa  491  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  68.82 
 
 
352 aa  485  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.816329  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  70.27 
 
 
343 aa  478  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1391  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  69.85 
 
 
348 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1387  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  69.55 
 
 
348 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1666  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  69.85 
 
 
348 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.44586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1493  cysteine synthase A  69.85 
 
 
333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.464198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1100  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  69.55 
 
 
349 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2323  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  70.03 
 
 
343 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0343  cysteine synthase A  65.56 
 
 
340 aa  433  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  60.78 
 
 
352 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  58.72 
 
 
344 aa  411  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2067  cysteine synthase A  61.38 
 
 
346 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1275  cysteine synthase A  62.46 
 
 
345 aa  413  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.175602  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1489  cysteine synthase A  67.28 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.926588  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  60.18 
 
 
332 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  62.27 
 
 
324 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  61.52 
 
 
372 aa  395  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  62.69 
 
 
338 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  62.12 
 
 
332 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  59.82 
 
 
323 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  58.36 
 
 
328 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  61.35 
 
 
324 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  59.82 
 
 
323 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  59.51 
 
 
326 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  58.9 
 
 
325 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  58.84 
 
 
324 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1616  cysteine synthase A  61.45 
 
 
327 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  59.51 
 
 
325 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  59.2 
 
 
324 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  60.31 
 
 
325 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  61.08 
 
 
324 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  59.45 
 
 
331 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  57.88 
 
 
334 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1893  cysteine synthase A  59.2 
 
 
326 aa  359  5e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.484332  normal  0.0992226 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08057  Cysteine synthase (CSase)(EC 2.5.1.47)(O-acetylserine sulfhydrylase)(O-acetylserine (thiol)-lyase)(OAS-TL) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P50867]  52.84 
 
 
370 aa  328  7e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05880  cysteine synthase, putative  52.41 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3653  cysteine synthase A  44.44 
 
 
370 aa  288  7e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59891  cysteine synthase (CYSK1)  48.77 
 
 
367 aa  288  7e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0439327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0676  cysteine synthase A  43.66 
 
 
362 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.79 
 
 
459 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.48 
 
 
459 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.22 
 
 
453 aa  239  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  38.18 
 
 
459 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.09 
 
 
459 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  40.36 
 
 
458 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  38.6 
 
 
326 aa  233  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41218  predicted protein  39.02 
 
 
414 aa  230  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  38.46 
 
 
332 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  42.68 
 
 
455 aa  222  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  39.14 
 
 
461 aa  222  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01513  hypothetical transmembrane protein (Eurofung)  39.94 
 
 
428 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  39.19 
 
 
463 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.32 
 
 
465 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.26 
 
 
496 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  42.6 
 
 
521 aa  213  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  40.31 
 
 
454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  39.88 
 
 
454 aa  212  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  40.5 
 
 
457 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.75 
 
 
479 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  38.23 
 
 
340 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  40.55 
 
 
456 aa  209  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  40.8 
 
 
454 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  40 
 
 
457 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  40.24 
 
 
456 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  35.78 
 
 
453 aa  206  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  41.21 
 
 
456 aa  206  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  39.81 
 
 
315 aa  206  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  39.76 
 
 
458 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  39.02 
 
 
456 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  37.8 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  37.9 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02520  cysteine synthase, putative  37.5 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  39.5 
 
 
479 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  41.67 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.36 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  38.81 
 
 
461 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  40.55 
 
 
456 aa  199  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>