More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54915 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_54915  eukaryotic cysteine synthase  100 
 
 		 356 aa  732    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30734  cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  44.79 
 
 		 392 aa  286  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.207324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41218  predicted protein  45.02 
 
 		 414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01513  hypothetical transmembrane protein (Eurofung)  42.15 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  44.21 
 
 		 334 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  45.21 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  43.11 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  44.25 
 
 		 324 aa  259  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  43.36 
 
 		 324 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  44.68 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02520  cysteine synthase, putative  41.03 
 
 		 458 aa  256  5e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  43.71 
 
 		 325 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  42.48 
 
 		 338 aa  255  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  44.14 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05880  cysteine synthase, putative  42.01 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.59 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  40.95 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  40.65 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  39.47 
 
 		 325 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  40.06 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  41.44 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1100  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.26 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  40.06 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.14 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  41.84 
 
 		 352 aa  243  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.43 
 
 		 343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08057  Cysteine synthase (CSase)(EC 2.5.1.47)(O-acetylserine sulfhydrylase)(O-acetylserine (thiol)-lyase)(OAS-TL) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P50867]  41.52 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41 
 
 		 352 aa  239  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.816329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  40.35 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  40.66 
 
 		 346 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4677  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.72 
 
 		 342 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  42.17 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1363  cysteine synthase A  40.24 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  41.23 
 
 		 332 aa  236  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  41.62 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1666  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.19 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  40.36 
 
 		 366 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59891  cysteine synthase (CYSK1)  40.48 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1617  cysteine synthase A  40 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1387  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.6 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1391  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.9 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2323  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.9 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1438  cysteine synthase A  39.71 
 
 		 345 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536284  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1493  cysteine synthase A  40.54 
 
 		 333 aa  228  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  40.36 
 
 		 345 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2314  putative cysteine synthase A  41.14 
 
 		 345 aa  226  7e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2140  cysteine synthase A  40.41 
 
 		 342 aa  225  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0676  cysteine synthase A  37.32 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1993  cysteine synthase A  39.07 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1018  cysteine synthase A  39.64 
 
 		 342 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1053  cysteine synthase A  39.34 
 
 		 342 aa  222  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0343  cysteine synthase A  38.14 
 
 		 340 aa  222  9e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1616  cysteine synthase A  40.06 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2067  cysteine synthase A  41.89 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1424  cysteine synthase A  39.34 
 
 		 346 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348736  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1439  cysteine synthase A  39.66 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159205  normal  0.177571 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1275  cysteine synthase A  39.83 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.175602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2922  cysteine synthase A  37.95 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3861  cysteine synthase A  38.44 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0819  cysteine synthase A  37.28 
 
 		 344 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3653  cysteine synthase A  36.47 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0821  cysteine synthase A  37.25 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0212219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2147  cysteine synthase A  37.25 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1489  cysteine synthase A  36.15 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.926588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.66 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1893  cysteine synthase A  40.3 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.484332  normal  0.0992226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1879  cysteine synthase  37.54 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.64 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  33.04 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  34.74 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.36 
 
 		 459 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  36.61 
 
 		 463 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.06 
 
 		 459 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  36.06 
 
 		 459 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.43 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  36.01 
 
 		 332 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  36.94 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  33.72 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  35.05 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  34.93 
 
 		 479 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.13 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.54 
 
 		 496 aa  175  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  37.8 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.63 
 
 		 479 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  34.85 
 
 		 453 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  36.14 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.23 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.74 
 
 		 465 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  35.98 
 
 		 302 aa  169  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  34.64 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  34.04 
 
 		 457 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  35.14 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  34.04 
 
 		 457 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  34.47 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  33.85 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  38.35 
 
 		 463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  37.17 
 
 		 461 aa  162  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  37.61 
 
 		 464 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  33.03 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  37.65 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>