More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02520 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH02520  cysteine synthase, putative  100 
 
 		 458 aa  937    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01513  hypothetical transmembrane protein (Eurofung)  52.24 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30734  cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  44.26 
 
 		 392 aa  342  7e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.207324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41218  predicted protein  49.05 
 
 		 414 aa  325  1e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  42.71 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  42.25 
 
 		 325 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  40.32 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.46 
 
 		 328 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  40.37 
 
 		 323 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  40.37 
 
 		 323 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  40.75 
 
 		 338 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  40.66 
 
 		 372 aa  258  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54915  eukaryotic cysteine synthase  41.03 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  41.13 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  40.05 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1666  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.42 
 
 		 348 aa  251  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1391  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.15 
 
 		 348 aa  249  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2922  cysteine synthase A  38.73 
 
 		 336 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  39.53 
 
 		 332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  39.52 
 
 		 345 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  40.32 
 
 		 345 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.42 
 
 		 325 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4677  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.69 
 
 		 342 aa  244  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.26 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  39.19 
 
 		 325 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1489  cysteine synthase A  38.68 
 
 		 335 aa  243  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.926588  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.8 
 
 		 343 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1100  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.23 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.04 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.816329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  38.62 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  38.9 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  38.63 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0343  cysteine synthase A  39.57 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1387  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.98 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  40 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  37.99 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  38.02 
 
 		 344 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  38.4 
 
 		 324 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  38.98 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1275  cysteine synthase A  38.44 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.175602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  37.67 
 
 		 332 aa  232  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2314  putative cysteine synthase A  39.67 
 
 		 345 aa  232  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2140  cysteine synthase A  39.79 
 
 		 342 aa  230  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3861  cysteine synthase A  38.03 
 
 		 343 aa  230  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1424  cysteine synthase A  38.42 
 
 		 346 aa  229  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1053  cysteine synthase A  38.86 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1018  cysteine synthase A  38.86 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2323  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.8 
 
 		 343 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1617  cysteine synthase A  37.97 
 
 		 345 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1438  cysteine synthase A  37.97 
 
 		 345 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536284  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1993  cysteine synthase A  38.24 
 
 		 341 aa  227  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1363  cysteine synthase A  37.23 
 
 		 346 aa  226  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1616  cysteine synthase A  38.71 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1493  cysteine synthase A  38.98 
 
 		 333 aa  224  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0821  cysteine synthase A  38.07 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0212219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2147  cysteine synthase A  38.07 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1439  cysteine synthase A  37.77 
 
 		 394 aa  223  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159205  normal  0.177571 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05880  cysteine synthase, putative  36.9 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3653  cysteine synthase A  37.93 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1879  cysteine synthase  39.13 
 
 		 345 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2067  cysteine synthase A  37.99 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08057  Cysteine synthase (CSase)(EC 2.5.1.47)(O-acetylserine sulfhydrylase)(O-acetylserine (thiol)-lyase)(OAS-TL) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P50867]  37 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0819  cysteine synthase A  37.5 
 
 		 344 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59891  cysteine synthase (CYSK1)  36.66 
 
 		 367 aa  216  8e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0676  cysteine synthase A  37.06 
 
 		 362 aa  216  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1893  cysteine synthase A  39.42 
 
 		 326 aa  202  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.484332  normal  0.0992226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  34.7 
 
 		 463 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.95 
 
 		 459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  34.7 
 
 		 457 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.04 
 
 		 459 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  33.51 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.77 
 
 		 459 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  34.43 
 
 		 457 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  36.22 
 
 		 312 aa  193  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  34.9 
 
 		 479 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  34.23 
 
 		 459 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  34.07 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.6 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  35.95 
 
 		 312 aa  190  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.7 
 
 		 332 aa  189  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  33.24 
 
 		 458 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.24 
 
 		 465 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  32.87 
 
 		 303 aa  182  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.24 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  33.78 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  34.53 
 
 		 304 aa  178  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.15 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  34.18 
 
 		 302 aa  176  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  33.89 
 
 		 315 aa  176  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  31.4 
 
 		 332 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  32.41 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.89 
 
 		 461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  32.55 
 
 		 464 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  33.33 
 
 		 327 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  33.43 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.63 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  29.95 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  33.79 
 
 		 304 aa  172  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  35.44 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  33.43 
 
 		 302 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>