More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30734 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30734  cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  100 
 
 		 392 aa  811    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.207324  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01513  hypothetical transmembrane protein (Eurofung)  53.12 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02520  cysteine synthase, putative  44.26 
 
 		 458 aa  319  5e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41218  predicted protein  42.59 
 
 		 414 aa  293  3e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54915  eukaryotic cysteine synthase  44.79 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  43.07 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.64 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  43.6 
 
 		 326 aa  250  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  42.99 
 
 		 325 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  41.87 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  42.69 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  42.73 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.9 
 
 		 328 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  41.77 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  41.46 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  41.46 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  41.52 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  41.34 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  40 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  40.73 
 
 		 334 aa  239  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  41.41 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.67 
 
 		 352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.816329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0343  cysteine synthase A  40.67 
 
 		 340 aa  225  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  41.05 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2140  cysteine synthase A  41.39 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.88 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_004310  BR1053  cysteine synthase A  41.28 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  41.36 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1018  cysteine synthase A  41.28 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  40.43 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  40.74 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  40.31 
 
 		 332 aa  220  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1666  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.82 
 
 		 348 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.43 
 
 		 343 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2323  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.64 
 
 		 343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1363  cysteine synthase A  40.74 
 
 		 346 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1275  cysteine synthase A  37.5 
 
 		 345 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.175602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1438  cysteine synthase A  42.59 
 
 		 345 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536284  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1391  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.39 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1424  cysteine synthase A  40.49 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348736  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  40.24 
 
 		 332 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1387  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.79 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05880  cysteine synthase, putative  36.87 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  39.81 
 
 		 345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1100  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.27 
 
 		 349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4677  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.82 
 
 		 342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08057  Cysteine synthase (CSase)(EC 2.5.1.47)(O-acetylserine sulfhydrylase)(O-acetylserine (thiol)-lyase)(OAS-TL) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P50867]  37.21 
 
 		 370 aa  212  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1617  cysteine synthase A  41.36 
 
 		 345 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1493  cysteine synthase A  39.14 
 
 		 333 aa  212  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464198 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0676  cysteine synthase A  37.46 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1893  cysteine synthase A  41.67 
 
 		 326 aa  211  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.484332  normal  0.0992226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  37.39 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2922  cysteine synthase A  39.81 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1489  cysteine synthase A  38.41 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.926588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.66 
 
 		 332 aa  206  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2147  cysteine synthase A  38.3 
 
 		 344 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0821  cysteine synthase A  38.3 
 
 		 344 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0212219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1993  cysteine synthase A  38.84 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3653  cysteine synthase A  39.02 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59891  cysteine synthase (CYSK1)  36.96 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439327 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2314  putative cysteine synthase A  37.99 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0819  cysteine synthase A  38.18 
 
 		 344 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1439  cysteine synthase A  37.16 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159205  normal  0.177571 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3861  cysteine synthase A  37.73 
 
 		 343 aa  196  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2067  cysteine synthase A  40.12 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  37.23 
 
 		 461 aa  192  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  37.35 
 
 		 315 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1616  cysteine synthase A  36.28 
 
 		 327 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  35.49 
 
 		 303 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  37 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1879  cysteine synthase  37.92 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  35.21 
 
 		 332 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.17 
 
 		 307 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.23 
 
 		 479 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  35.91 
 
 		 302 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  35.35 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  35.56 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  35.56 
 
 		 307 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  34.46 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  34.94 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  33.43 
 
 		 463 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.42 
 
 		 465 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  34.04 
 
 		 479 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  34.86 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  34.86 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  34.86 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  34.64 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  34.86 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  34.86 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1362  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.43 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  34.86 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  34.86 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.12 
 
 		 456 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.76 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  34.46 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.22 
 
 		 459 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.25 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  34.83 
 
 		 327 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.95 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  36.62 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>