More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1424 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1424  cysteine synthase A  100 
 
 		 346 aa  699    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1053  cysteine synthase A  77.71 
 
 		 342 aa  565  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1018  cysteine synthase A  77.42 
 
 		 342 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2140  cysteine synthase A  77.13 
 
 		 342 aa  557  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  77.22 
 
 		 345 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1438  cysteine synthase A  76.25 
 
 		 345 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536284  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1617  cysteine synthase A  75.8 
 
 		 345 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1363  cysteine synthase A  76.04 
 
 		 346 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  77.54 
 
 		 343 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  74.63 
 
 		 345 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4677  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  75.68 
 
 		 342 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  75.22 
 
 		 346 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  75.96 
 
 		 366 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1879  cysteine synthase  76.97 
 
 		 345 aa  528  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2147  cysteine synthase A  70.93 
 
 		 344 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0821  cysteine synthase A  70.93 
 
 		 344 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0212219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3861  cysteine synthase A  72.02 
 
 		 343 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2922  cysteine synthase A  74.01 
 
 		 336 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  75.77 
 
 		 332 aa  502  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2314  putative cysteine synthase A  69.97 
 
 		 345 aa  501  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  72.7 
 
 		 352 aa  501  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.816329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1439  cysteine synthase A  70.41 
 
 		 394 aa  498  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159205  normal  0.177571 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0819  cysteine synthase A  69.48 
 
 		 344 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  74.47 
 
 		 343 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1993  cysteine synthase A  69.97 
 
 		 341 aa  488  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1666  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  71.47 
 
 		 348 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2323  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  69.63 
 
 		 343 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1391  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  71.47 
 
 		 348 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1100  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  69.79 
 
 		 349 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1387  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  70.86 
 
 		 348 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1493  cysteine synthase A  68.9 
 
 		 333 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  62.65 
 
 		 352 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  63.8 
 
 		 344 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2067  cysteine synthase A  62.35 
 
 		 346 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0343  cysteine synthase A  62.61 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  65.53 
 
 		 332 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  64.78 
 
 		 338 aa  411  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  60.5 
 
 		 325 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  62.58 
 
 		 324 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  61.49 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  62.66 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1275  cysteine synthase A  62.31 
 
 		 345 aa  411  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.175602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  61.44 
 
 		 326 aa  408  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  62.66 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  62.11 
 
 		 372 aa  404  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  60.86 
 
 		 332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1489  cysteine synthase A  65.75 
 
 		 335 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.926588  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  62.46 
 
 		 324 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  61.88 
 
 		 331 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  60.82 
 
 		 324 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  60.19 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  61.13 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  59.32 
 
 		 325 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1616  cysteine synthase A  62.73 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  56.34 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  58.07 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1893  cysteine synthase A  60.25 
 
 		 326 aa  373  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.484332  normal  0.0992226 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08057  Cysteine synthase (CSase)(EC 2.5.1.47)(O-acetylserine sulfhydrylase)(O-acetylserine (thiol)-lyase)(OAS-TL) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P50867]  53.94 
 
 		 370 aa  338  9e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05880  cysteine synthase, putative  53.21 
 
 		 405 aa  335  5.999999999999999e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254646  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59891  cysteine synthase (CYSK1)  51.38 
 
 		 367 aa  306  4.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0676  cysteine synthase A  43.57 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3653  cysteine synthase A  42.63 
 
 		 370 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  43.08 
 
 		 463 aa  252  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.19 
 
 		 459 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  38.72 
 
 		 459 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.02 
 
 		 459 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.72 
 
 		 459 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  39.75 
 
 		 332 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.32 
 
 		 453 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  38.96 
 
 		 458 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41218  predicted protein  39.94 
 
 		 414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.94 
 
 		 496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  38.2 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  40.06 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  41.3 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01513  hypothetical transmembrane protein (Eurofung)  40.65 
 
 		 428 aa  226  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  40.99 
 
 		 457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  40.68 
 
 		 479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  40 
 
 		 453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  37.65 
 
 		 340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30734  cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  40.49 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.207324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  38.73 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02520  cysteine synthase, putative  38.42 
 
 		 458 aa  212  7e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.39 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1362  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.68 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  34.76 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  41.46 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  39.81 
 
 		 455 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  41.67 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  40.78 
 
 		 303 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  39.43 
 
 		 521 aa  209  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.62 
 
 		 479 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.69 
 
 		 465 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  41.16 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  39.75 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  41.43 
 
 		 455 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  39.94 
 
 		 454 aa  206  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.29 
 
 		 456 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  41.07 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  36.64 
 
 		 459 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>