31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0949 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0949  CBS domain-containing protein  100 
 
 
162 aa  324  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0833  CBS domain-containing protein  90.62 
 
 
162 aa  300  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_820  CBS domain protein  86.88 
 
 
162 aa  287  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1813  CBS domain-containing protein  32.2 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0324  putative signal transduction protein with CBS domains  24.79 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.93 
 
 
215 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  31.93 
 
 
215 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  27.56 
 
 
224 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.5 
 
 
489 aa  43.9  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
223 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  44.9 
 
 
251 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  30.63 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  30.63 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  30.63 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  25 
 
 
182 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1807  signal-transduction protein  28.77 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  27.27 
 
 
480 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  29.25 
 
 
461 aa  41.6  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  40 
 
 
154 aa  41.6  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 
609 aa  41.2  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 
634 aa  41.2  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  39.58 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  39.58 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  29.41 
 
 
219 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  26.24 
 
 
246 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  29.06 
 
 
461 aa  40.8  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  29.06 
 
 
461 aa  40.8  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1014  putative signal transduction protein with CBS domains  28.32 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.137576 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  24.03 
 
 
608 aa  40.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  38 
 
 
380 aa  40.4  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>