More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0315 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  100 
 
 
609 aa  1174    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  94.91 
 
 
634 aa  1105    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  53.79 
 
 
603 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  52.56 
 
 
604 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  51.37 
 
 
600 aa  513  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  51.95 
 
 
605 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  52.7 
 
 
603 aa  487  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  55.46 
 
 
634 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  48.28 
 
 
593 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  49.08 
 
 
595 aa  458  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  47.76 
 
 
605 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  47.59 
 
 
595 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  48.02 
 
 
595 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  49.46 
 
 
584 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  47.85 
 
 
595 aa  438  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  47.41 
 
 
595 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  47.86 
 
 
595 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  47.86 
 
 
595 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  47.86 
 
 
595 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  48.94 
 
 
605 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  50.68 
 
 
590 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  48.94 
 
 
605 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  49.82 
 
 
637 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  44.44 
 
 
606 aa  420  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  49.64 
 
 
599 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  45.61 
 
 
633 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  45.23 
 
 
623 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0837  Chloride channel core  46.88 
 
 
596 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0439  chloride channel (ClC) family protein  44.6 
 
 
634 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.662875  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1138  chloride channel (ClC) family protein  44.6 
 
 
634 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1199  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  44.6 
 
 
634 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0005  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  46.22 
 
 
590 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  45.23 
 
 
623 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0161  chloride channel (ClC) family protein  44.6 
 
 
634 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3930  voltage-gated chloride channel  47.21 
 
 
599 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000147499 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1397  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  45.07 
 
 
618 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  37.52 
 
 
613 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  33.01 
 
 
577 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  31.25 
 
 
590 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.21 
 
 
582 aa  197  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  28.02 
 
 
608 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  30.12 
 
 
593 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  29.45 
 
 
613 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.23 
 
 
614 aa  184  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.87 
 
 
569 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  30.14 
 
 
606 aa  170  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  28.09 
 
 
669 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.21 
 
 
597 aa  167  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  31.88 
 
 
615 aa  166  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  32.37 
 
 
470 aa  165  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.77 
 
 
587 aa  161  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.02 
 
 
626 aa  160  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  27.15 
 
 
631 aa  160  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.12 
 
 
584 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  28.52 
 
 
598 aa  158  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.96 
 
 
580 aa  152  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  34.49 
 
 
456 aa  151  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  28.88 
 
 
600 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.05 
 
 
620 aa  151  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.1 
 
 
612 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  30.04 
 
 
629 aa  148  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  24.05 
 
 
617 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  26.31 
 
 
627 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.71 
 
 
598 aa  145  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  26.92 
 
 
627 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  26.75 
 
 
602 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  27.05 
 
 
605 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  30.58 
 
 
402 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  26.47 
 
 
603 aa  141  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  28.04 
 
 
625 aa  140  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.36 
 
 
591 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.96 
 
 
598 aa  140  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  24.54 
 
 
598 aa  140  8.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.34 
 
 
575 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  27.7 
 
 
624 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.01 
 
 
589 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.01 
 
 
589 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  27.66 
 
 
586 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.81 
 
 
589 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.98 
 
 
577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  25.84 
 
 
579 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.8 
 
 
594 aa  133  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25 
 
 
591 aa  133  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  27.37 
 
 
863 aa  133  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  25.06 
 
 
579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.88 
 
 
593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.87 
 
 
754 aa  131  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.88 
 
 
593 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  27.86 
 
 
589 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  27.86 
 
 
589 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0957  Chloride channel core  33.7 
 
 
615 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  28.66 
 
 
897 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.78 
 
 
591 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0815  voltage-gated chloride channel  33.11 
 
 
590 aa  127  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.49 
 
 
589 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  26.99 
 
 
628 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  25.77 
 
 
594 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  26.07 
 
 
863 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  26.96 
 
 
859 aa  124  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  28.1 
 
 
875 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>