More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2794 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  100 
 
 
608 aa  1217    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  52.05 
 
 
614 aa  623  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  53.39 
 
 
613 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.04 
 
 
582 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  40.79 
 
 
615 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  40.98 
 
 
669 aa  324  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  36.07 
 
 
577 aa  296  6e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  34.5 
 
 
606 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  38.2 
 
 
600 aa  277  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  34.33 
 
 
590 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  34.11 
 
 
591 aa  270  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  32.87 
 
 
627 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  30.27 
 
 
631 aa  262  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  40.88 
 
 
626 aa  262  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.41 
 
 
594 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  34.07 
 
 
597 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  34.2 
 
 
593 aa  260  6e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  32.35 
 
 
640 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.19 
 
 
587 aa  256  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  34.33 
 
 
602 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.36 
 
 
598 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.34 
 
 
579 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.35 
 
 
636 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.35 
 
 
628 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.34 
 
 
579 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.34 
 
 
579 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.4 
 
 
591 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.77 
 
 
589 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  31.56 
 
 
613 aa  246  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.14 
 
 
598 aa  244  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  30.77 
 
 
628 aa  242  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  30.85 
 
 
624 aa  239  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.02 
 
 
593 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  34.66 
 
 
605 aa  239  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  32.92 
 
 
569 aa  239  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.02 
 
 
593 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.51 
 
 
620 aa  238  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.36 
 
 
589 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  38.03 
 
 
584 aa  236  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.29 
 
 
612 aa  236  9e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.36 
 
 
589 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.36 
 
 
589 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.76 
 
 
591 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  30.15 
 
 
627 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.39 
 
 
580 aa  231  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  33.33 
 
 
470 aa  228  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  31.33 
 
 
603 aa  228  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.92 
 
 
577 aa  227  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  31.03 
 
 
629 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  27.92 
 
 
617 aa  224  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  29.79 
 
 
598 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  31.82 
 
 
579 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  33.2 
 
 
605 aa  220  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  28.03 
 
 
603 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  30.7 
 
 
579 aa  219  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  31.63 
 
 
651 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  29.44 
 
 
614 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  33.79 
 
 
586 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  34.51 
 
 
589 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  34.51 
 
 
589 aa  210  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.37 
 
 
603 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  37.85 
 
 
402 aa  204  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  28.96 
 
 
625 aa  203  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.41 
 
 
575 aa  201  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.11 
 
 
754 aa  196  9e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  30.22 
 
 
604 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  34.55 
 
 
543 aa  195  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3124  Cl- channel, voltage gated  29.37 
 
 
596 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  30.79 
 
 
598 aa  194  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  36.54 
 
 
527 aa  193  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2181  Cl- channel voltage-gated family protein  29.92 
 
 
634 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  29.86 
 
 
603 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1257  chloride channel-like  32.21 
 
 
615 aa  188  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95023  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  36.78 
 
 
456 aa  186  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  32.89 
 
 
897 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  30.24 
 
 
594 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.3 
 
 
461 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  31.9 
 
 
464 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  31.9 
 
 
464 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.08 
 
 
591 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  29.18 
 
 
605 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  29.18 
 
 
605 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  30.98 
 
 
462 aa  177  5e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  32.21 
 
 
562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  28.92 
 
 
605 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  31.7 
 
 
564 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  29.17 
 
 
585 aa  174  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  28.06 
 
 
600 aa  174  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  29.8 
 
 
585 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  31.03 
 
 
590 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  30.39 
 
 
623 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  28.74 
 
 
606 aa  171  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  28.79 
 
 
595 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  30.22 
 
 
623 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  29.46 
 
 
586 aa  170  8e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  29.6 
 
 
595 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  28.3 
 
 
582 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  28.11 
 
 
595 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  30.15 
 
 
863 aa  169  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.94 
 
 
595 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>