More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47178 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  41.41 
 
 
142 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  39.39 
 
 
147 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 
145 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.88 
 
 
147 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 
145 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  37.67 
 
 
146 aa  99.4  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  39.26 
 
 
163 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  41.6 
 
 
164 aa  97.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 
145 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 
145 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  40.15 
 
 
146 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  39.69 
 
 
144 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  38.17 
 
 
146 aa  95.5  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  41.46 
 
 
142 aa  95.5  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  37.5 
 
 
158 aa  95.1  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  37.4 
 
 
144 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  38.93 
 
 
144 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  40.91 
 
 
146 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  36.72 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  40.62 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  37.12 
 
 
146 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  42.28 
 
 
153 aa  92  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  36.99 
 
 
145 aa  91.7  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  41.46 
 
 
154 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  41.46 
 
 
154 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  41.46 
 
 
154 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  41.46 
 
 
154 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
149 aa  91.3  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  41.46 
 
 
154 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  41.46 
 
 
154 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  41.46 
 
 
154 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  36.3 
 
 
145 aa  91.3  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  37.4 
 
 
146 aa  91.3  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  34.35 
 
 
140 aa  90.5  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  38.28 
 
 
141 aa  90.9  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  39.84 
 
 
143 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  38.93 
 
 
153 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  38.93 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  38.93 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  38.93 
 
 
153 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  39.06 
 
 
142 aa  89  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  38.28 
 
 
142 aa  88.6  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  38.17 
 
 
153 aa  88.6  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  36.3 
 
 
146 aa  88.6  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.84 
 
 
143 aa  88.2  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 
120 aa  88.2  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  38.17 
 
 
153 aa  87.8  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  37.31 
 
 
146 aa  87  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  37.4 
 
 
145 aa  87  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  34.01 
 
 
146 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  38.17 
 
 
153 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  36.72 
 
 
148 aa  85.5  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  39.39 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  34.35 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  35.25 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  36.22 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  36.92 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  36.04 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  35.16 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  35.14 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.81 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  36 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  35.48 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  34.11 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  29.69 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  40.21 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.91 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  35.45 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  28.91 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.1 
 
 
688 aa  65.9  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  28.12 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  34.48 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  33.33 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  31.53 
 
 
141 aa  63.2  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  34.51 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  30.84 
 
 
150 aa  63.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  39.56 
 
 
139 aa  63.2  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  31.54 
 
 
142 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 
688 aa  63.2  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.91 
 
 
488 aa  62.4  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  34.78 
 
 
143 aa  62.8  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  32.73 
 
 
136 aa  62.8  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  31.86 
 
 
138 aa  62  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  25.93 
 
 
139 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
142 aa  62  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 
196 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  35.05 
 
 
131 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2057  putative signal transduction protein with CBS domains  30.43 
 
 
134 aa  61.6  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  34.86 
 
 
143 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  32.73 
 
 
143 aa  61.6  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  32.28 
 
 
143 aa  61.6  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2704  CBS domain containing protein  27.82 
 
 
158 aa  61.2  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 
142 aa  61.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  61.2  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  36.36 
 
 
139 aa  61.2  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  30.43 
 
 
139 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  32 
 
 
142 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>