17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_820 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_820  CBS domain protein  100 
 
 		 162 aa  324  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0833  CBS domain-containing protein  89.51 
 
 		 162 aa  297  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0949  CBS domain-containing protein  86.88 
 
 		 162 aa  287  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0324  putative signal transduction protein with CBS domains  26.5 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1813  CBS domain-containing protein  31.9 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  28.36 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 489 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1014  putative signal transduction protein with CBS domains  27.87 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.137576 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1807  signal-transduction protein  29.2 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  40 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  27.56 
 
 		 224 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  29.81 
 
 		 428 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1845  signal-transduction protein  26.76 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  31.11 
 
 		 494 aa  41.2  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  36.76 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  29.84 
 
 		 385 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  27.88 
 
 		 427 aa  40.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>