20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1509 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1509  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 163 aa  331  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1015  CBS domain-containing protein  36.02 
 
 		 163 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.110354  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1014  putative signal transduction protein with CBS domains  37.34 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.137576 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  35.53 
 
 		 192 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  0.539633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1513  CBS domain-containing protein  35.85 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2361  putative signal transduction protein with CBS domains  29.88 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0963  putative signal transduction protein with CBS domains  38.89 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158107  normal  0.526521 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1813  CBS domain-containing protein  32.47 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1607  CBS domain-containing protein  28.83 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1999  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0965  CBS domain-containing protein  31.45 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000272777  normal  0.399502 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  25.44 
 
 		 301 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0795  CBS domain-containing protein  23.86 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0152604  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1990  CBS domain containing protein  26.45 
 
 		 283 aa  44.7  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2721  putative signal transduction protein with CBS domains  26.38 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2338  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1495  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.09 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  27.33 
 
 		 373 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  25.47 
 
 		 229 aa  40.8  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>