More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0340 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  46.15 
 
 		 185 aa  88.2  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  36.52 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  41.07 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  37.39 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  44.14 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  45.28 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  36.67 
 
 		 272 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  38.26 
 
 		 187 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  42.11 
 
 		 688 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  42.11 
 
 		 688 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  35.65 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  35.65 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  34.48 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  43.64 
 
 		 704 aa  65.5  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  36.52 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.17 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  36.75 
 
 		 845 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  40 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  36.21 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  32.17 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  35.25 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  36.28 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  31.09 
 
 		 623 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  36.28 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  36.84 
 
 		 480 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  36.21 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  36.28 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  36.52 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  37.61 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  35.14 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  37.39 
 
 		 688 aa  63.5  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  34.78 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  36.52 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  35.34 
 
 		 189 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  31.03 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.04 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  36 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  36.52 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  34.53 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  35.65 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  35.9 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  35.65 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  35.65 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  33.91 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.52 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  33.63 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  35.71 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  31.3 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  33.93 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  33.9 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  35.04 
 
 		 615 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  36.67 
 
 		 313 aa  60.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  35.04 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  34.78 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  37.61 
 
 		 769 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 286 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  45 
 
 		 624 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  49.09 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  40.24 
 
 		 282 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  32.17 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  37.5 
 
 		 606 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  31.9 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  31.86 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  33.05 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  33.93 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  37.5 
 
 		 606 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  32.48 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  31.67 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  39.34 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  47.76 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  44.44 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  36.51 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  32.76 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  32.48 
 
 		 615 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  41.86 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  35.34 
 
 		 865 aa  58.9  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  32.14 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  33.91 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.48 
 
 		 615 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  44.16 
 
 		 478 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  32.48 
 
 		 615 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  37.5 
 
 		 284 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  34.19 
 
 		 614 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>