More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3311 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  40.15 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  39.39 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  41.41 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  40.15 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  40.15 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  40.15 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  39.39 
 
 		 138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  41.48 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  38.64 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  40.15 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  38.64 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  42.42 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  37.88 
 
 		 138 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  36.36 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  38.76 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  38.76 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  38.76 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  38.76 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  37.12 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  41.41 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  37.8 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  37.23 
 
 		 139 aa  91.3  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  34.9 
 
 		 247 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  37.01 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  34.72 
 
 		 246 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  33.83 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  32.56 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  33.86 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  29.77 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  35.82 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  34.92 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  36.72 
 
 		 201 aa  80.1  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  31.76 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  32.06 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  32.21 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  29.86 
 
 		 230 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  35.03 
 
 		 230 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  37.6 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  39.67 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  32.17 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  32.19 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  33.8 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  31.76 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  30.61 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  32.68 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.52 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  34.51 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  33.04 
 
 		 493 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  30.41 
 
 		 243 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  33.56 
 
 		 348 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  31.72 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  32.03 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.34 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  28.86 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  30.07 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.19 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  30.87 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  29.25 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  34.9 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  41.96 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  41.96 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  31.15 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0119  CBS domain containing protein  32.43 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.851715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.38 
 
 		 243 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  32.87 
 
 		 236 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  31.15 
 
 		 217 aa  67  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  30.47 
 
 		 309 aa  67  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  34.81 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  31.37 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  32.26 
 
 		 300 aa  67  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  31.06 
 
 		 234 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  30 
 
 		 537 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  35.81 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  28.37 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  29.86 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.86 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  26.49 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  29.41 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  31.62 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  29.25 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  32.52 
 
 		 907 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  28.47 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  32.41 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  27.97 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  29.05 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>