209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1506 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  285  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  81.16 
 
 		 138 aa  233  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  81.16 
 
 		 138 aa  233  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  80.43 
 
 		 138 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  79.71 
 
 		 138 aa  229  9e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  80.43 
 
 		 138 aa  229  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  80.29 
 
 		 138 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  80.29 
 
 		 138 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  80.29 
 
 		 138 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  80.29 
 
 		 138 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  77.54 
 
 		 138 aa  221  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  72.99 
 
 		 138 aa  215  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  72.46 
 
 		 138 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  71.01 
 
 		 138 aa  209  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  73.19 
 
 		 138 aa  206  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  67.39 
 
 		 138 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 		 146 aa  123  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  40.88 
 
 		 139 aa  120  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  44.44 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  41.79 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  43.7 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  41.3 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  40.58 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  37.78 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  40.32 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  37.12 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 131 aa  93.2  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  30.83 
 
 		 491 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  36.45 
 
 		 558 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  29.14 
 
 		 508 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  36.45 
 
 		 537 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  35.19 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  35.51 
 
 		 493 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  28.47 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  29.36 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  25.53 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  27.93 
 
 		 494 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  24.14 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  28.18 
 
 		 128 aa  57  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  26.35 
 
 		 483 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  28.36 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  27.39 
 
 		 483 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  28.04 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  26.87 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  26.95 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  25.9 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  31.37 
 
 		 483 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  33.04 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  28.23 
 
 		 875 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  27.43 
 
 		 281 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  33.71 
 
 		 896 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  29.03 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  22.69 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.93 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  29.03 
 
 		 875 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  26.55 
 
 		 280 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  28.17 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  24.49 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  28.32 
 
 		 280 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  28.83 
 
 		 875 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  27.1 
 
 		 279 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  26.36 
 
 		 242 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  28.26 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2661  CBS domain-containing protein  26.12 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.611003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  27.68 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  28.26 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  27.43 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  28.45 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  27.52 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  26.21 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  26.09 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  26.55 
 
 		 282 aa  49.7  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  24.56 
 
 		 313 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  24.09 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  24.48 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  26.17 
 
 		 279 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  25.87 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  28.97 
 
 		 904 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  21.28 
 
 		 247 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  25.2 
 
 		 370 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  25.4 
 
 		 201 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  23.68 
 
 		 279 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  25.35 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.46 
 
 		 490 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  21.43 
 
 		 246 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  26.17 
 
 		 279 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  27.84 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  24.11 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  31.18 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  31.11 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  27.66 
 
 		 909 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  27.1 
 
 		 907 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2704  CBS domain containing protein  30.21 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  22.76 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>