More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1253 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  271  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  46.15 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  43.75 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  41.94 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  42.19 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  42.19 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  40.62 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  45.16 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  43.75 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  39.53 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  42.97 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  42.97 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  42.97 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  42.19 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  40.32 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  38.76 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  40.62 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  41.41 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  41.41 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  41.41 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  41.41 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  40.48 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  36.89 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  43.33 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  40.82 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  34.43 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  39.09 
 
 		 508 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  36.29 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  31.01 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  37.27 
 
 		 537 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  33.64 
 
 		 493 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  31.08 
 
 		 152 aa  67  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  35.45 
 
 		 558 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  28.3 
 
 		 483 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.95 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  32.73 
 
 		 494 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  34.38 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  33.64 
 
 		 491 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  27.67 
 
 		 483 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  29.05 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  27.4 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  30.61 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  28.08 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  30.34 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  28.57 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  34.92 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  29.37 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  28.57 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  28.89 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  28.78 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  30.43 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  28.77 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  28.67 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  27.33 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.71 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  35.42 
 
 		 427 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  32.61 
 
 		 242 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.52 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  28.67 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 376 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  30.14 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  33.59 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0705  putative transcriptional regulator, XRE family  36.13 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  28.69 
 
 		 496 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  25.64 
 
 		 483 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  31.4 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  29.37 
 
 		 500 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  29.5 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.59 
 
 		 628 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  32.71 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 		 410 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.35 
 
 		 476 aa  54.3  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 		 279 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  29.37 
 
 		 242 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.34 
 
 		 640 aa  53.9  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  29.41 
 
 		 219 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  25.68 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  29.08 
 
 		 249 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  27.42 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  29.51 
 
 		 309 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2357  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  37.36 
 
 		 435 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.889148  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  28.57 
 
 		 281 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  30.26 
 
 		 241 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.57 
 
 		 482 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  29.81 
 
 		 280 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  28.28 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  28.78 
 
 		 247 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  30.92 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 282 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>