More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2242 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  297  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  53.97 
 
 		 139 aa  146  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  46.81 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  46.81 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  47.62 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  42.34 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  42.34 
 
 		 139 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  40.88 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  41.61 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  41.27 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  41.54 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  40.77 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  40.48 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  39.68 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  40.48 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  39.68 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  39.68 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  39.68 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  38.1 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  37.3 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  38.1 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  38.1 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  38.1 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  38.89 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  43.33 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  35.88 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  34.92 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  31.79 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  28.68 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  28.1 
 
 		 491 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  29.22 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  29.69 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  28.57 
 
 		 558 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  28.45 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  29.31 
 
 		 494 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  31.82 
 
 		 508 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  26.21 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  25.6 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  25.66 
 
 		 483 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  29.09 
 
 		 213 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  30.48 
 
 		 537 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  30.41 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  24.83 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  28 
 
 		 710 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  28.48 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  23.24 
 
 		 683 aa  54.3  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  26.8 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  27.7 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  26.09 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 		 242 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  34.23 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0729  signal transduction protein  33.59 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0315509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  22.84 
 
 		 247 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  24.6 
 
 		 379 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  25.5 
 
 		 427 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  30.16 
 
 		 309 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  29.51 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  21.64 
 
 		 483 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  23.48 
 
 		 225 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.21 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  23.68 
 
 		 483 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1203  signal transduction protein  27.66 
 
 		 315 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.803351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  28 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  24.82 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  26.15 
 
 		 262 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  31.5 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  24.43 
 
 		 231 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  27.97 
 
 		 503 aa  51.6  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  25.5 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  25.5 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 		 321 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 		 321 aa  51.2  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  28.18 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  29.13 
 
 		 221 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  24.31 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  26.15 
 
 		 261 aa  50.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  25.48 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  26.05 
 
 		 234 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  29.46 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  20.14 
 
 		 228 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.78 
 
 		 476 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  21.6 
 
 		 246 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  28.37 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  31.3 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  31.3 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  31.3 
 
 		 214 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  31.3 
 
 		 214 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  21.25 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  28.18 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  23.45 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  31.3 
 
 		 214 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  26.83 
 
 		 226 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>