More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1712 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  266  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  43.65 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  44.53 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  42.06 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  42.86 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  42.86 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  42.86 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  42.06 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  39.68 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  39.68 
 
 		 138 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  39.68 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  39.68 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  39.68 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  39.85 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  38.1 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  39.84 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  36.51 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  37.01 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  38.35 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  40.48 
 
 		 136 aa  97.1  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 138 aa  93.2  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 		 143 aa  93.2  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  34.65 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  36.22 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 		 146 aa  90.1  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  35.11 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  30.47 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  32.73 
 
 		 493 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  33.83 
 
 		 201 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  35.24 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  30.65 
 
 		 491 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  31.82 
 
 		 537 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  29.57 
 
 		 494 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  33.02 
 
 		 508 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  31.71 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  32.31 
 
 		 230 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  31.75 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 		 907 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  28.28 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.54 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.83 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  28.97 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  28.97 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  34.13 
 
 		 904 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  32.87 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  27.89 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  27.14 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  28.08 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  28.97 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  29.86 
 
 		 229 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  28.76 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  31.16 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  28.57 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 		 246 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  35.59 
 
 		 393 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  26.9 
 
 		 152 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  26.62 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  28.77 
 
 		 223 aa  60.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.5 
 
 		 903 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  26.21 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  28.23 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  26.21 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  26.8 
 
 		 483 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  29.03 
 
 		 688 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  28.47 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  30.89 
 
 		 909 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  28.57 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  27.92 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  28.57 
 
 		 688 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  26.87 
 
 		 217 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  26.35 
 
 		 242 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  26.17 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  30.25 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  30.08 
 
 		 880 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  28.97 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  26.45 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  31.86 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  30.95 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  34.86 
 
 		 885 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  32 
 
 		 909 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  31.09 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  31.09 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>