More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02402 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  65.47 
 
 		 139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  44.53 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  46.32 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  47.62 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  44.44 
 
 		 138 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  45.45 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  44.44 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  43.7 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  41.48 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  44.53 
 
 		 139 aa  115  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  44.44 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  43.7 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  43.7 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  43.7 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  43.7 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  43.7 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  43.07 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  42.96 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  42.14 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  42.96 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  42.96 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  42.96 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  37.96 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  39.85 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  44.35 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  35.71 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  37.01 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  31.9 
 
 		 493 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  29.66 
 
 		 537 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  29.93 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  28.93 
 
 		 491 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  31.65 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  29.81 
 
 		 483 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  25.66 
 
 		 483 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  26.96 
 
 		 558 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  27.59 
 
 		 494 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  31.48 
 
 		 483 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 232 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  30.23 
 
 		 309 aa  63.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  28.05 
 
 		 229 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  28.47 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  30.71 
 
 		 508 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  28.28 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  27.46 
 
 		 227 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  26.8 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  28.77 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  26.21 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  28.77 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  30.58 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  32.58 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  31.78 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  29.08 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  23.78 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  26.19 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  25.95 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  23.94 
 
 		 426 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  26.19 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  26.06 
 
 		 230 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.95 
 
 		 191 aa  57  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  26.22 
 
 		 229 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  26.75 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  27.89 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  27.27 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  27.89 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  24.84 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  27.89 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  32.31 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  27.48 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  30.95 
 
 		 364 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  24.48 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 246 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  23.61 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  26.21 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  30.5 
 
 		 223 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  29.25 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  28.47 
 
 		 217 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  27.21 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  28.77 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  23.88 
 
 		 217 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  27.66 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  25.83 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  29.03 
 
 		 427 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  25.56 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  28.24 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  24.31 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.73 
 
 		 488 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  30.89 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  26.03 
 
 		 242 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  29.66 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  25.4 
 
 		 261 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>