More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2064 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  287  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  55.07 
 
 		 146 aa  169  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  56.12 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  56.83 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  45.26 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  45.65 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  45.99 
 
 		 138 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  43.07 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  44.53 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  43.07 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  45.99 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  42.34 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  41.61 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  42.65 
 
 		 143 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  42.34 
 
 		 138 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  42.34 
 
 		 138 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  41.61 
 
 		 138 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  40.58 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  40.58 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  40.58 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  40.58 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  42.34 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  40.88 
 
 		 138 aa  120  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  46.15 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  40.3 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  39.37 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  37.96 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  38.76 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  36.51 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  33.83 
 
 		 141 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  35.45 
 
 		 493 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  34.51 
 
 		 558 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  33.09 
 
 		 508 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  32.73 
 
 		 494 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  30.43 
 
 		 491 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  31.78 
 
 		 537 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  34.43 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  29.22 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  25.48 
 
 		 483 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  26.8 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  26.11 
 
 		 483 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  31.94 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  31.13 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  30.08 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.5 
 
 		 191 aa  62  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  25.49 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  32.8 
 
 		 862 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  30.4 
 
 		 483 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  30.72 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  33.87 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  30.08 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 		 370 aa  60.8  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  30.34 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  29.86 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  29.17 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  33.94 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  27.04 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  31.75 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  30.56 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  23.53 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  31.39 
 
 		 608 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  33.33 
 
 		 897 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  26.52 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  29.66 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  29.03 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  28.47 
 
 		 230 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  30.58 
 
 		 859 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  29.73 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  31.94 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  31.01 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  29.66 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  29.86 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  27.61 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  30.66 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  27.27 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  27.4 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  32.62 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  27.2 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  26.98 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 		 640 aa  55.5  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  27.61 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  30.34 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  35.34 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  27.69 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  29.85 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  28.47 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  26.4 
 
 		 378 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  28.19 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  27.97 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  28 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  31.71 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  30.71 
 
 		 875 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>