More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004008 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  100 
 
 		 139 aa  284  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  91.37 
 
 		 139 aa  265  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  73.38 
 
 		 146 aa  209  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  56.12 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  45.65 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  47.1 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  47.1 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  47.79 
 
 		 143 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  45.59 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  43.48 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  43.48 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  44.2 
 
 		 138 aa  127  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  44.2 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  44.2 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  45.65 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  43.88 
 
 		 138 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  44.2 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  42.34 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  41.73 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  41.73 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  41.73 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  41.73 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  44.53 
 
 		 148 aa  115  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  40.3 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  41.3 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  39.53 
 
 		 136 aa  106  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  38.35 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  37.9 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  36.22 
 
 		 135 aa  87.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  31.2 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  32.76 
 
 		 493 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  31.9 
 
 		 491 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  27.1 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  27.74 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  28.48 
 
 		 494 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  34.43 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  26.32 
 
 		 537 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  25.48 
 
 		 508 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  27.42 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  28.48 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  31.75 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  30.4 
 
 		 513 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.82 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.29 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  28.8 
 
 		 513 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.29 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  29.84 
 
 		 300 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  27.94 
 
 		 309 aa  60.1  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 225 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  24.52 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.77 
 
 		 845 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  29.61 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  27.62 
 
 		 558 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  27.07 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  31.06 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2164  CBS domain containing protein  30.33 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  27.56 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  28.8 
 
 		 513 aa  59.3  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1105  putative signal transduction protein with CBS domains  31.97 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  27.66 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  31.78 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  28.47 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  25.34 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  26 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  27.22 
 
 		 483 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3243  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100628  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  32.77 
 
 		 875 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  25.49 
 
 		 483 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  28.08 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  25.33 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  30.61 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3486  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000172668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  28.08 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  33.61 
 
 		 875 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  31.11 
 
 		 862 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1898  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 270 aa  57  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527597  normal  0.365874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 		 251 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  28.8 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  27.89 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  28.95 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  26.53 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.08 
 
 		 490 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  26.87 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  27.7 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  26.47 
 
 		 378 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  30 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  25.34 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>