More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3486 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3486  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 221 aa  424  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000172668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  52.61 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  47.58 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  44.68 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  45.41 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  44.98 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  28.05 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  30.82 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  33.33 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  32.21 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  36.76 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  35.82 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  25.6 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  25.78 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  21.85 
 
 		 161 aa  61.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  29.86 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  31.08 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  32.28 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  26.72 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  33.59 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  33.59 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  33.59 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  33.97 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3527  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 		 159 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  31.3 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  28.89 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  31.54 
 
 		 149 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  34.94 
 
 		 874 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  25.95 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  34.97 
 
 		 416 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28.35 
 
 		 155 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.81 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  29.66 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  30.71 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  27.92 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  27.45 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  25.35 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  26.9 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  29.29 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  34.04 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 		 863 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  25.25 
 
 		 390 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 131 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  33.07 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 		 152 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 		 863 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  31.94 
 
 		 378 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  23.84 
 
 		 151 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  26.24 
 
 		 149 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  32.65 
 
 		 374 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  30.99 
 
 		 457 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  30.89 
 
 		 147 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0729  signal transduction protein  20.74 
 
 		 132 aa  53.1  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0315509  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  27.69 
 
 		 138 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 431 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 		 150 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  31.21 
 
 		 436 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  28.36 
 
 		 281 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  26.81 
 
 		 139 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  33.73 
 
 		 872 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 427 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  27.33 
 
 		 161 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  27.63 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 		 392 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  29.08 
 
 		 404 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  28.35 
 
 		 132 aa  52  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2710  CBS domain-containing membrane protein  33.07 
 
 		 157 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.828048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 		 875 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  29.1 
 
 		 133 aa  52  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  30.41 
 
 		 457 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  24.29 
 
 		 155 aa  51.6  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  28.47 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  26.36 
 
 		 875 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  20 
 
 		 513 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  24.6 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 		 391 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  25.98 
 
 		 907 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  26.72 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  31.29 
 
 		 348 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  24.63 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  26.28 
 
 		 388 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  25.58 
 
 		 300 aa  51.2  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 168 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  18.83 
 
 		 492 aa  51.2  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 		 391 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  30.95 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  27.48 
 
 		 138 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  23.81 
 
 		 147 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  20 
 
 		 513 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 		 873 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  26.12 
 
 		 845 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  30.23 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>