More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2016 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  288  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2074  signal transduction protein  69.01 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  49.65 
 
 		 141 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  48.94 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  46.48 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  42.55 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4373  CBS domain-containing protein  48.78 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  41.84 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  41.09 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.43 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  34.67 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  29.66 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  33.33 
 
 		 423 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  36.99 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  34.59 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 		 225 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  36.36 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  32.12 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  28.87 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  37.01 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.97 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  34.25 
 
 		 246 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  32 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  36.99 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  35.43 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  28.77 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  33.86 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 		 390 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  31.47 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  35.71 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  30.82 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  34.11 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  31.91 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  32.03 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  29.85 
 
 		 219 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  33.82 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  28.97 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  33.33 
 
 		 307 aa  63.9  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  33.33 
 
 		 226 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 226 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  27.52 
 
 		 234 aa  63.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  33.06 
 
 		 503 aa  63.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  30.53 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  26.56 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  30.14 
 
 		 426 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  27.39 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  33.08 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  32.41 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  30.99 
 
 		 416 aa  62  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  34.96 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  32.17 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  33.85 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  27.82 
 
 		 488 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  29.41 
 
 		 513 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  28 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  31.08 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  34.96 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  29.71 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  31.78 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  28.77 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.97 
 
 		 492 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  28.78 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  34.96 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  28 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  29.87 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 		 391 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  29.69 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  33.85 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  32.31 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 		 399 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  29.69 
 
 		 427 aa  60.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07600  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.95 
 
 		 498 aa  60.5  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.194742 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>