More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2431 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  100 
 
 		 138 aa  283  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  76.81 
 
 		 138 aa  228  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  75.36 
 
 		 138 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  75.36 
 
 		 138 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  74.64 
 
 		 138 aa  223  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  73.91 
 
 		 138 aa  221  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  73.72 
 
 		 138 aa  221  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  72.99 
 
 		 138 aa  217  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  72.99 
 
 		 138 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  72.99 
 
 		 138 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  71.74 
 
 		 138 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  72.99 
 
 		 138 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  72.46 
 
 		 138 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  70.29 
 
 		 138 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  72.46 
 
 		 138 aa  208  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  66.67 
 
 		 138 aa  193  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  44.53 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  42.34 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  44.2 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  44.44 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  43.7 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  41.3 
 
 		 139 aa  120  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  44.44 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  43.75 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  39.26 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  41.27 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  44.53 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  40.3 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  38.64 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  34.81 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  37.4 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  35.71 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  31.21 
 
 		 508 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  32.46 
 
 		 558 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  30.83 
 
 		 493 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  30 
 
 		 491 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  27.59 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 537 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  29.63 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  28.28 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  29.66 
 
 		 888 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.22 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  32.8 
 
 		 688 aa  61.6  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  28.95 
 
 		 483 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  28.7 
 
 		 494 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2661  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.611003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  29.03 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  29.25 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  31.2 
 
 		 688 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  28.89 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  29.55 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  27.5 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.9 
 
 		 486 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 		 242 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.8 
 
 		 873 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  28.47 
 
 		 230 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 		 232 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  28.08 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.5 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  24.82 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  28.77 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  28.46 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  27.78 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  27.01 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 896 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  26.32 
 
 		 483 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  31.45 
 
 		 769 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  30.58 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  29.03 
 
 		 907 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.49 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.16 
 
 		 888 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  29.32 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.97 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  30.63 
 
 		 904 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  29.73 
 
 		 873 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 		 279 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0705  putative transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  26.23 
 
 		 300 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  31.54 
 
 		 216 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.51 
 
 		 845 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1776  putative PAS/PAC sensor protein  23.66 
 
 		 698 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  27.93 
 
 		 880 aa  52.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  30.97 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  28.93 
 
 		 280 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 279 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  28.78 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  25.85 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  28.35 
 
 		 300 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  34.21 
 
 		 863 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  30.77 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  30.84 
 
 		 280 aa  52  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  28.45 
 
 		 907 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  26.71 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>