262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2259 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  100 
 
 		 138 aa  283  5.999999999999999e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  48.85 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  45.45 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  42.54 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  44.78 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 		 139 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  44.03 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  41.79 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  40.3 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  42.54 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  41.04 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  40.3 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  41.79 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  41.79 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  41.04 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  41.54 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  41.04 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  41.04 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  41.04 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  40.3 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  41.01 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  41.01 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  42.54 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  41.01 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  41.01 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  38.69 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  40.82 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  39.17 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  36.51 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  35.24 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  29.87 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  29.45 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  29.45 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  33.88 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  28.3 
 
 		 558 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  26.87 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.78 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  30.1 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2704  CBS domain containing protein  28.46 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3293  DRTGG domain-containing protein  32.58 
 
 		 437 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  25.5 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.01 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  28 
 
 		 246 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4744  thioesterase family protein  31.46 
 
 		 437 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4505  thioesterase family protein  31.46 
 
 		 437 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4341  CBS domain-containing cytosolic protein  31.46 
 
 		 437 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4353  CBS domain-containing cytosolic protein  31.46 
 
 		 437 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.67 
 
 		 508 aa  52  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  31 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4858  thioesterase family protein  31.46 
 
 		 437 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  33.04 
 
 		 234 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4739  thioesterase family protein  31.46 
 
 		 437 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  27.84 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4727  thioesterase family protein  31.46 
 
 		 437 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  28.7 
 
 		 250 aa  51.6  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  26 
 
 		 427 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4720  thioesterase family protein  30.34 
 
 		 437 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  27.78 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  25.17 
 
 		 230 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0517  thioesterase family protein  30.34 
 
 		 437 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  27.1 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  25.33 
 
 		 231 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 219 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  27.78 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  31.96 
 
 		 380 aa  50.1  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  24.66 
 
 		 428 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  30.3 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0546  putative signal-transduction protein with CBS and DRTGG domains  31.18 
 
 		 434 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.76 
 
 		 426 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  23.48 
 
 		 309 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  25.23 
 
 		 491 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4440  signal-transduction protein  29.21 
 
 		 437 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  34.02 
 
 		 286 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  23.45 
 
 		 427 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  29 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  28.87 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  27.59 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  33.63 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 279 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  29.06 
 
 		 286 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  29.91 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  26.83 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0705  putative transcriptional regulator, XRE family  29.27 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2695  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  38.18 
 
 		 438 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  26.61 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  26.32 
 
 		 221 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  27.62 
 
 		 128 aa  47.4  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0768  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  27.83 
 
 		 435 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  28.69 
 
 		 295 aa  47  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  24.36 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  32.79 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  26.21 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  26.52 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0468  CBS domain containing membrane protein  24.09 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>