More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0256 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  294  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  41.27 
 
 
138 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  44.35 
 
 
148 aa  100  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 
143 aa  99.4  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  38.76 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  38.69 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  39.84 
 
 
138 aa  97.8  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  39.52 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  39.02 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  39.02 
 
 
138 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  39.02 
 
 
138 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 
136 aa  93.6  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  38.21 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  38.21 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  38.21 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  38.21 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  37.9 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  40.65 
 
 
138 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  37.9 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  39.06 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  36.59 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  37.4 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  34.62 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  35.88 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  35.77 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  29.77 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  30.08 
 
 
154 aa  72  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  29.22 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  31.54 
 
 
508 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  28.99 
 
 
483 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  29.8 
 
 
227 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  26.03 
 
 
246 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  28.97 
 
 
242 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  31.25 
 
 
230 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  33.33 
 
 
309 aa  60.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  33.06 
 
 
191 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  31.85 
 
 
231 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  32.26 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  29.01 
 
 
493 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  27.52 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  26.92 
 
 
243 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  29.37 
 
 
379 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  26.45 
 
 
243 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  28.21 
 
 
243 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  31.45 
 
 
558 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.85 
 
 
426 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  28.85 
 
 
234 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  37.11 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  32.46 
 
 
491 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  29.84 
 
 
494 aa  57.8  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  28.19 
 
 
226 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28.23 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  25.34 
 
 
247 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  24.36 
 
 
242 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  27.4 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  26.36 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  29.1 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.7 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  28.36 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.41 
 
 
640 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  28.23 
 
 
281 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  28.46 
 
 
862 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  30.89 
 
 
859 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  27.86 
 
 
201 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  29.05 
 
 
537 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  35.96 
 
 
202 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  28.19 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  23.38 
 
 
242 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.92 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  29.1 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  25.34 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  29.08 
 
 
158 aa  53.5  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  25 
 
 
246 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  32.28 
 
 
193 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  25.5 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  28.46 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  25.97 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  32.54 
 
 
223 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  30.3 
 
 
875 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  23.78 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  23.77 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 
150 aa  52  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  28.69 
 
 
907 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  26.43 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  26.45 
 
 
380 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  25.81 
 
 
280 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  26.87 
 
 
137 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1068  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 
228 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.23 
 
 
903 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  29.03 
 
 
155 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  32.61 
 
 
640 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>